RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 GCHFRP30047 84 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CENPWQ5EE01 88 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TMEM136Q6ZRR5 245 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 GCNT2Q8N0V5 402 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 OR52L2PQ8NGH6 319 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 RAB1CQ92928 201 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 NINJ1Q92982 152 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 C15orf62A8K5M9 175 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 OR2H2O95918 312 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CRYBB3P26998 211 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ARR3P36575 388 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 GNG3P63215 75 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ASPHD1Q5U4P2 390 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 MDS2Q8NDY4 140 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 FAM234AQ9H0X4 552 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 C21orf140B9A014 251 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ZNF883P0CG24 379 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CX3CL1P78423 397 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TIGITQ495A1 244 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PN81 502 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 IGLC7A0M8Q6 106 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 DEFB108AA8MXU0 73 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 NUDT3O95989 172 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CGAP01215 116 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 MORN2Q502X0 79 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 PRR31Q5SQ13 230 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 HES3Q5TGS1 186 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TREML4Q6UXN2 200 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ZNF645Q8N7E2 425 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 Q8N7P7 452 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 OR5B3Q8NH48 314 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 MS4A5Q9H3V2 200 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 MT-CO2P00403 227 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 USF1P22415 310 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TNXAQ16473 311 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 LTC4SQ16873 150 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 SLC24A4Q8NFF2 622 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 GALMQ96C23 342 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 SELENOKQ9Y6D0 94 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TFF1P04155 84 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 VWC2Q2TAL6 325 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 PRR27Q6MZM9 219 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 MOB1BQ7L9L4 216 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 LINC00596Q86U02 117 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 RFESDQ8TAC1 157 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CORO2AQ92828 525 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 OR2T8A6NH00 312 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3-43DP0DP04 118 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ABHD12Q8N2K0 398 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 NHLRC2Q8NBF2 726 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 MGST2Q99735 147 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 OPRK1P41145 380 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ZNF497Q6ZNH5 498 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 PNKDQ8N490 385 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 OR5B21A6NL26 309 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 LYZL6O75951 148 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 HLA-DQA1P01909 254 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 PPBPP02775 128 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 AMY1AP04745 511 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 PSG5Q15238 335 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 Q6P435 159 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 GGTLC1Q9BX51 225 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 CHODLQ9H9P2 273 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 GP6Q9HCN6 339 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 RAB29O14966 203 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 ZNF718Q3SXZ3 478 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 OR4F17Q8NGA8 305 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 SVILO95425 2214 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 CDIPTO14735 213 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 SELENOVP59797 346 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms