RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q6ZSN1	163 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC01551	Q86U37	167 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCDC190	Q86UF4	302 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	FGFRL1	Q8N441	504 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR1P1	Q8NH06	330 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR52I2	Q8NH67	350 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	MCFD2	Q8NI22	146 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00052	Q96N35	136 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF714	Q96N38	554 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	PECR	Q9BY49	303 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	MMP26	Q9NRE1	261 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPG11	Q96JI7	2443 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A0A6YYD4	124 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1W2PRF3	423 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1W2PRM7	423 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638		M0R1W7	72 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNAPC5	O75971	98 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHG4	P01861	327 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF728	P0DKX0	622 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCL3L1	P16619	93 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	FGF7	P21781	194 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	DLK1	P80370	383 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	BAX	Q07812	192 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLA2G7	Q13093	441 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBE2V1	Q13404	147 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	NIT1	Q86X76	327 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	GPHA2	Q96T91	129 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SMR3A	Q99954	134 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	ABCG5	Q9H222	651 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ECHDC1-208	ENST00000436638	RNF212B	A8MTL3	300 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	MFNG	O00587	321 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPINT2	O43291	252 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	SOX15	O60248	233 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	LYL1	P12980	280 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	GNB3	P16520	340 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	CDK2	P24941	298 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM50B	P56557	158 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	PAX8	Q06710	450 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAGE5	Q13069	117 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAGE6	Q13070	117 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRSS8	Q16651	343 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	LTC4S	Q16873	150 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q5BKY6	102 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	ASB13	Q8WXK3	278 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	DYRK2	Q92630	601 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARL11	Q969Q4	196 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	CXorf58	Q96LI9	332 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	CALY	Q9NYX4	217 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		5.02	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms