RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427487.5

HDLBP-215, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-215ENST00000427487 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 TEX22C9J3V5 150 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 WRBO00258 174 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 SIX6O95475 246 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 CRYBA1P05813 215 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 CRYGCP07315 174 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 LYL1P12980 280 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 BLCAPP62952 87 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 RPP30P78346 268 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 DTD1Q8TEA8 209 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 SMIM8Q96KF7 97 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 CLCC1Q96S66 551 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 HIPK2Q9H2X6 1198 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 ENY2Q9NPA8 101 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 TMEM89A2RUT3 159 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 MSGN1A6NI15 193 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 CGB1A6NKQ9 187 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 H3BUA1 57 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 K7EPK0 472 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 CYB5BO43169 146 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 TSC22D2O75157 780 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 DEDDO75618 318 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 CCNKO75909 580 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 MPC2O95563 127 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 HTR2BP41595 481 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 NDPQ00604 133 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 RAB32Q13637 225 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 BSXQ3C1V8 233 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 PVRIGQ6DKI7 326 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 AKAP14Q86UN6 197 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 OR2C3Q8N628 320 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 RBKSQ9H477 322 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF702PQ9H963 129 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 A0A1B0GUS0 222 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 A0A1B0GW64 132 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 E5RGE8 158 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 E7EUB6 86 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 ATP6V0E1O15342 81 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 SLC25A4P12235 298 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 CTRB1P17538 263 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 GNB1P62873 340 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 CD83Q01151 205 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 TMEM65Q6PI78 240 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 OR1P1Q8NH06 330 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 THAP6Q8TBB0 222 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 CORTO00230 105 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 P2RY1P47900 373 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 WT1-ASQ06250 92 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 C2orf83Q53S99 150 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 C11orf87Q6NUJ2 197 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 Q6ZSV7 163 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 STPG2Q8N412 459 aa9.49□□□□□ -0.89
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HDLBP-215ENST00000427487 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 NEURL2Q9BR09 285 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 RNF126Q9BV68 326 aa9.49□□□□□ -0.89
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HDLBP-215ENST00000427487 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 PARP11Q9NR21 331 aa9.49□□□□□ -0.89
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HDLBP-215ENST00000427487 HMSDA8MTL9 139 aa9.48□□□□□ -0.89
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HDLBP-215ENST00000427487 OR13C7P0DN81 318 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 PPIFP30405 207 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 SNCAP37840 140 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 PAX9P55771 341 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 VAMP2P63027 116 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 CFHR3Q02985 330 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-215ENST00000427487 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.48□□□□□ -0.89
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