RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB3B	P20337	219 aa		8.85	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	RANBP1	P43487	201 aa		8.85	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2B8P	P59922	312 aa		8.85	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	8.85	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		8.85	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF585B	Q52M93	769 aa		8.85	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	HACD4	Q5VWC8	232 aa		8.85	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZWC4	215 aa		8.85	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	MFSD4A	Q8N468	514 aa		8.85	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	CENPO	Q9BU64	300 aa		8.85	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		8.85	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		8.85	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A5	O76082	557 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	DHFR	P00374	187 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	CTXN2	P0C2S0	81 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	PTHLH	P12272	177 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	DEFA4	P12838	97 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	MYL9	P24844	172 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	BMI1	P35226	326 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	C22orf42	Q6IC83	251 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	CNIH2	Q6PI25	160 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2C3	Q8N628	320 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	MARC2	Q969Z3	335 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	CXorf58	Q96LI9	332 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	BET1L	Q9NYM9	111 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		8.84	□□□□□ -0.99
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	HRAS	P01112	189 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	GAL	P22466	123 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	APOC4	P55056	127 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL6IP1	Q15041	203 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF773	Q6PK81	442 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF183	Q96D59	192 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		8.83	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN4	O14817	238 aa		8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	TGOLN2	O43493	480 aa		8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	RPA2	P15927	270 aa		8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	GNG2	P59768	71 aa		8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	PLET1	Q6UQ28	207 aa		8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		8.82	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	ERICH4	A6NGS2	130 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2T8	A6NH00	312 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338		F8W735	103 aa	Predicted RBP	8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	SULT1C2	O00338	296 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	UPK2	O00526	184 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	8.81	□□□□□ -1	1e-11	■■□□□ 13.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	MFAP2	P55001	183 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF124	Q15973	351 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	POU2AF1	Q16633	256 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	OR4A5	Q8NH83	315 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	NOTO	A8MTQ0	251 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2C	O00762	179 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	8.8	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	FCGR2C	P31995	323 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	ADM	P35318	185 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	TAS2R31	P59538	309 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	WT1-AS	Q06250	92 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	MSMO1	Q15800	293 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	STPG3	Q8N7X2	389 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	BEST4	Q8NFU0	473 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-233	ENST00000602338	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	8.8	□□□□□ -1

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