RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	RARRES2	Q99969	163 aa		7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	DKK2	Q9UBU2	259 aa		7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4C46	A6NHA9	309 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	FCGR3B	O75015	233 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC3B	P05452	202 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR183	P32249	361 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	P2RY14	Q15391	338 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	PLET1	Q6UQ28	207 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT14	Q96FL9	552 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	PECR	Q9BY49	303 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	HSF4	Q9ULV5	492 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		7.98	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	MPTX1	A8MV57	137 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511		J3QRK9	145 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5H	O75947	161 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	GAL	P22466	123 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	GCSH	P23434	173 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	CRHBP	P24387	322 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMD7	P51665	324 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	ST3GAL4	Q11206	333 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	INSL4	Q14641	139 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD9	Q7L273	389 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	PHYHIP	Q92561	330 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	C5orf30	Q96GV9	206 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	CXorf58	Q96LI9	332 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	NEU1	Q99519	415 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51E2	Q9H255	320 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		7.97	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	MARCH11	A6NNE9	402 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00473	A8K010	186 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX22	C9J3V5	150 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN4	O14817	238 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	REG1A	P05451	166 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CD1A	P06126	327 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	AREG	P15514	252 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	RPA2	P15927	270 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMB6	P28072	239 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT4	P56705	351 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	QRFP	P83859	136 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	OR11H2	Q8NH07	326 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4A5	Q8NH83	315 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2A7	Q96R45	310 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CSTL1	Q9H114	145 aa		7.96	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB27B	O00194	218 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB4A	O15263	64 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	FCGR3A	P08637	254 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf88	P0DMB2	117 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	TALDO1	P37837	337 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	MFAP2	P55001	183 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM50B	P56557	158 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB11B	Q15907	218 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	SETD9	Q8NE22	299 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CYGB	Q8WWM9	190 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	7.95	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A075B6Q4	140 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf94	C9JXX5	98 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	KBTBD11	O94819	623 aa		7.94	□□□□□ -1.14

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