RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 GPX8Q8TED1 209 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 MOB3AQ96BX8 217 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 CCDC140Q96MF4 163 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 TMEM140Q9NV12 185 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 BET1LQ9NYM9 111 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 NSG2Q9Y328 171 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 UPK2O00526 184 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 HPRT1P00492 218 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 CTRB1P17538 263 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 HLA-GP17693 338 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 PSMB6P28072 239 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 MAS1LP35410 378 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 LPAR6P43657 344 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 CATR1Q13166 79 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 MSMO1Q15800 293 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 GPR107Q5VW38 600 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 NECAP1Q8NC96 275 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 DMBX1Q8NFW5 382 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 FCAMRQ8WWV6 532 aa8.06□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 FAM25AB3EWG3 89 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 FAM25CB3EWG5 89 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 FAM25GB3EWG6 89 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 M0QYG6 137 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 GABARAPO95166 117 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 APOA1P02647 267 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 CRYGCP07315 174 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 NQO2P16083 231 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 G6PCP35575 357 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 TAS2R31P59538 309 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 TAS2R46P59540 309 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 ZNF585BQ52M93 769 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 DBX1A6NMT0 343 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 KRASP01116 189 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 DEFA4P12838 97 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 ARL3P36405 182 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 RORCP51449 518 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 MECP2P51608 486 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 TSPAN5P62079 268 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 POU2AF1Q16633 256 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 OR4A5Q8NH83 315 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 RCHY1Q96PM5 261 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 KLK11Q9UBX7 282 aa8.04□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 MARCH11A6NNE9 402 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 GPR31O00270 319 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 PI3P19957 117 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 F2RP25116 425 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 MFAP2P55001 183 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 WT1-ASQ06250 92 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 SPCS2Q15005 226 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 TATDN3Q17R31 274 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 OR52I2Q8NH67 350 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 HINT2Q9BX68 163 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 COMMD5Q9GZQ3 224 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 EXTL2Q9UBQ6 330 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 C2orf70A6NJV1 201 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 ZNF785A8K8V0 405 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 H0Y980 276 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 CTDSP2O14595 271 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 IGKV1-39P01597 117 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 IGKV1D-39P04432 117 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 CLEC3BP05452 202 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 CD7P09564 240 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 OR13C7P0DN81 318 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 FOLR2P14207 255 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 GPR183P32249 361 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 RCVRNP35243 200 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 ALDH3B2P48448 385 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 ERVK-16P61578 105 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.02□□□□□ -1.13
NELFE-213ENST00000494956 LCN12Q6JVE5 192 aa8.02□□□□□ -1.13
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