RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAV3A0A0B4J244 114 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 CGB1A6NKQ9 187 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 BMPR1BO00238 502 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 GPR31O00270 319 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 UPK2O00526 184 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 DHFRP00374 187 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 CRYGCP07315 174 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 RPA2P15927 270 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 RCVRNP35243 200 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 CMTM1Q8IZ96 169 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 COMMD9Q9P000 198 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 REG1AP05451 166 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 CSN3P07498 182 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 CTRB1P17538 263 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 F2RP25116 425 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 OR2B8PP59922 312 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 ERVK-16P61578 105 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM209BQ5JX69 171 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 CTRB2Q6GPI1 263 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 FANCD2OSQ96PS1 177 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 COMMD5Q9GZQ3 224 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 NDUFB8O95169 186 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 DEFA4P12838 97 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 LPAR6P43657 344 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 PHLDA2Q53GA4 152 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 GPR141Q7Z602 305 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 FCAMRQ8WWV6 532 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 PEMTQ9UBM1 199 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 U3KQK5 164 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 MARCH11A6NNE9 402 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP5D1E7EU14 171 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 H0Y980 276 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 IGHV3-23P01764 117 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 FGF2P09038 288 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 S100GP29377 79 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 ALDH3B2P48448 385 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 LPCAT3Q6P1A2 487 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 EXTL2Q9UBQ6 330 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 S4R3C0 116 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 IGLC7A0M8Q6 106 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 GGCTO75223 188 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 KRASP01116 189 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 KLK9Q2XQG4 91 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF585BQ52M93 769 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC140Q96MF4 163 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 KLK9Q9UKQ9 250 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 DMRT1Q9Y5R6 373 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 M0QYG6 137 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 OR2C1O95371 312 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 G6PCP35575 357 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 ARL3P36405 182 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 UCP3P55916 312 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 LCN12Q6JVE5 192 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 CLEC19AQ6UXS0 136 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 SBSPONQ8IVN8 264 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 Q8N1Y9 231 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 OR10W1Q8NGF6 305 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 KLK11Q9UBX7 282 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 SNAPC5O75971 98 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 IFNA6P05013 189 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAPPC2P0DI81 140 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAPPC2BP0DI82 140 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D26Q86UD7 250 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC38A6Q8IZM9 456 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 Q8N402 240 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 OR1L8Q8NGR8 309 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 OR52I2Q8NH67 350 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 CXorf58Q96LI9 332 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 NSG2Q9Y328 171 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-211ENST00000493436 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 IZUMO1RA6ND01 250 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 MFSD2BA6NFX1 497 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 RGS5O15539 181 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 TPPPO94811 219 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 OR13C7P0DN81 318 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 MECP2P51608 486 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 SPCS2Q15005 226 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 SGPP2Q8IWX5 399 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 CADM3Q8N126 398 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 C15orf40Q8WUR7 153 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 ABHD1Q96SE0 405 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 HINT2Q9BX68 163 aa12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms