RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488087.1

ECHDC1-217, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC1, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-217ENST00000488087 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 WDR34Q96EX3 536 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 SEC22AQ96IW7 307 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 PRAP1Q96NZ9 151 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 KLHDC3Q9BQ90 382 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 C20orf24Q9BUV8 137 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 VAMP8Q9BV40 100 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 OR11A1Q9GZK7 315 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 COA1Q9GZY4 146 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 CST11Q9H112 138 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 BANF2Q9H503 90 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 TMEM9BQ9NQ34 198 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 TMEM38BQ9NVV0 291 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ANAPC11Q9NYG5 84 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 CLN8Q9UBY8 286 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 OR51B2Q9Y5P1 312 aa2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 SCN8AQ9UQD0 1980 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 LTBP1Q14766 1721 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 A0A1W2PRS3 328 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 IGLC7A0M8Q6 106 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 TSPAN11A1L157 253 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 TMEM189A5PLL7 270 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 FAM231BA6NCW3 169 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF727A8MUV8 499 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 J3QLW9 94 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 PIRO00625 290 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 AGPAT2O15120 278 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 SIVA1O15304 175 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 OR7C2O60412 319 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 DEDDO75618 318 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 RCBTB2O95199 551 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 CD160O95971 181 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 CYB5AP00167 134 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 CSN2P05814 226 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 STAG3L2P0CL84 134 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 CCL2P13500 99 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 CD99P14209 185 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF708P17019 499 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 COX5AP20674 150 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 FUT3P21217 361 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 PTNP21246 168 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 KITLGP21583 273 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 PYCR1P32322 319 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 GABRA3P34903 492 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 LEPP41159 167 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 GABRA2P47869 451 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 OR12D2P58182 307 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 TPPP2P59282 170 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ARG2P78540 354 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF117Q03924 483 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 Q0VG73 95 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 FZD2Q14332 565 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 IHHQ14623 411 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF77Q15935 545 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 Q499Y3 187 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 C2orf83Q53S99 150 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF684Q5T5D7 378 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ASCL5Q7RTU5 278 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 NEGR1Q7Z3B1 354 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 TMEM144Q7Z5S9 345 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 CMTM1Q8IZ96 169 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 MUC15Q8N387 334 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 CHST4Q8NCG5 386 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 OR5A2Q8NGI9 324 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 OR51G1Q8NGK1 321 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 OR4P4Q8NGL7 312 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 OR5K2Q8NHB8 316 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 CLDND2Q8NHS1 167 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF563Q8TA94 476 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF596Q8TC21 504 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 DOK4Q8TEW6 326 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 OR10C1Q96KK4 312 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 CXCL16Q9H2A7 254 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 OR52D1Q9H346 318 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 PRSS16Q9NQE7 514 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 OR2S2Q9NQN1 319 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ARL5AQ9Y689 179 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 WSB1Q9Y6I7 421 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 FRMPD3Q5JV73 1810 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 BRWD3Q6RI45 1802 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 SBF1O95248 1867 aa2.69□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
ECHDC1-217ENST00000488087 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms