RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486587.1

LRSAM1-208, Transcript of leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1, human

TSL 3

Gene LRSAM1, Length 827 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRSAM1-208	ENST00000486587	ARL3	P36405	182 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	OR2B8P	P59922	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	CD81	P60033	236 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	NCS1	P62166	190 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	TENM2	Q9NT68	2774 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587		A0A087WXM4	84 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	C2orf70	A6NJV1	201 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	DEFA4	P12838	97 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	NQO2	P16083	231 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	TAS2R31	P59538	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	HAGH	Q16775	308 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	CASC10	Q5T4H9	136 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587		A8MZ25	164 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	UPK2	O00526	184 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	TNFAIP8	O95379	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	HPRT1	P00492	218 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	CRYGC	P07315	174 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	CD7	P09564	240 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	FOLR2	P14207	255 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	GNRHR	P30968	328 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	GUCA2B	Q16661	112 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	OR4A5	Q8NH83	315 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	MOB3A	Q96BX8	217 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LRSAM1-208	ENST00000486587	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	DHFR	P00374	187 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	HLA-DMA	P28067	261 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	GPR183	P32249	361 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	HRH1	P35367	487 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	VBP1	P61758	197 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	POU2AF1	Q16633	256 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	CITED4	Q96RK1	184 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	NEURL2	Q9BR09	285 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	COMMD9	Q9P000	198 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	NSG2	Q9Y328	171 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	LYL1	P12980	280 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	TAS2R46	P59540	309 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	DEFB125	Q8N687	156 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	SPATA25	Q9BR10	227 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	HINT2	Q9BX68	163 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	PALMD	Q9NP74	551 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	LYST	Q99698	3801 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	MARCH11	A6NNE9	402 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF785	A8K8V0	405 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	TMEM127	O75204	238 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	PRSS3	P35030	304 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	ERVK-16	P61578	105 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	TPPP	O94811	219 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	NAT1	P18440	290 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	G6PC	P35575	357 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	LPAR6	P43657	344 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	WT1-AS	Q06250	92 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	FAM209B	Q5JX69	171 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	BTNL8	Q6UX41	500 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	ISOC1	Q96CN7	298 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LRSAM1-208	ENST00000486587	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		13.49	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 310.9 ms