RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 SPIN2AQ99865 258 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 HRASLSQ9HDD0 168 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 COMMD9Q9P000 198 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 NSG2Q9Y328 171 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 DBX1A6NMT0 343 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 MARCH11A6NNE9 402 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 OVOL1O14753 267 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 CTDSPLO15194 276 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 OR2J3O76001 311 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 KRASP01116 189 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 CRYGCP07315 174 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 PSMB6P28072 239 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 MAS1LP35410 378 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 PPP5CP53041 499 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TAS2R19P59542 299 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF343Q6P1L6 599 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 DMBX1Q8NFW5 382 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 MCFD2Q8NI22 146 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 BORCS5Q969J3 196 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0G2JLM5 398 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC160A6NGH7 325 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFB8O95169 186 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 RAB3DO95716 219 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 IFNA6P05013 189 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 CTRB1P17538 263 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TBPP20226 339 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 OR4C16Q8NGL9 310 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 USMG5Q96IX5 58 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 PRR25Q96S07 402 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 S4R3C0 116 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 FABP12A6NFH5 140 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 BMPR1BO00238 502 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-23P01764 117 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 PGAM2P15259 253 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 ECI1P42126 302 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 PIGPP57054 158 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 RND3P61587 244 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 ATP5G2Q06055 141 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 WT1-ASQ06250 92 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 KLK9Q2XQG4 91 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 C15orf32Q32M92 178 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 ACSM6Q6P461 480 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TERB2Q8NHR7 220 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 SEC22AQ96IW7 307 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TP53RKQ96S44 253 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 V9GYH0 126 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 FAM223BA6NKX1 122 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 PPP5D1E7EU14 171 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 SAP30O75446 220 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV1-5P01602 117 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 MFAP2P55001 183 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 SYNJ2BPP57105 145 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 ERVK-16P61578 105 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF79Q15937 498 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 SP6Q3SY56 376 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 CADM3Q8N126 398 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 NECAP1Q8NC96 275 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC140Q96MF4 163 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms