RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC2AQ6UVW9 174 aa18.18■□□□□ 0.5
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PTPRM-211ENST00000580170 GCHFRP30047 84 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 C2orf68Q2NKX9 166 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV3-11P04433 115 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 PRSS8Q16651 343 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 OR4C13Q8NGP0 309 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 C19orf24Q9BVV8 132 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 FGF11Q92914 225 aa18.17■□□□□ 0.5
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PQM1 296 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFAF3Q9BU61 184 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 SPCS1Q9Y6A9 102 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 NPIPB6E9PJ23 425 aa18.17■□□□□ 0.5
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PTPRM-211ENST00000580170 SFXN3Q9BWM7 321 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 RAXQ9Y2V3 346 aa18.16■□□□□ 0.5
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PTPRM-211ENST00000580170 NPIPB4C9JG80 1138 aa18.16■□□□□ 0.5
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PTPRM-211ENST00000580170 GDF9O60383 454 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 OR9G1Q8NH87 305 aa18.16■□□□□ 0.5
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PTPRM-211ENST00000580170 TMEM186Q96B77 213 aa18.16■□□□□ 0.5
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PTPRM-211ENST00000580170 CENPWQ5EE01 88 aa18.15■□□□□ 0.5
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PTPRM-211ENST00000580170 OR4D5Q8NGN0 318 aa18.15■□□□□ 0.5
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PTPRM-211ENST00000580170 SPSB2Q99619 263 aa18.14■□□□□ 0.49
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PTPRM-211ENST00000580170 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
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PTPRM-211ENST00000580170 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa18.12■□□□□ 0.49
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PTPRM-211ENST00000580170 TMEM250H0YL14 139 aa18.12■□□□□ 0.49
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF414Q96IQ9 312 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 GPX1P07203 203 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 RPRMQ9NS64 109 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRM-211ENST00000580170 JKAMPQ9P055 326 aa18.11■□□□□ 0.49
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