RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		8.04	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	AK3	Q9UIJ7	227 aa		8.04	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	BET1	O15155	118 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYZL1	O95825	349 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R43	P59537	309 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2K	P61086	200 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	RAP2B	P61225	183 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	TPBG	Q13641	420 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC23	Q5W5X9	447 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	GPHB5	Q86YW7	130 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2C3	Q8N628	320 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	APH1B	Q8WW43	257 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF183	Q96D59	192 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	MFF	Q9GZY8	342 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNK15	Q9H427	330 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511		Q9N2K0	584 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		8.03	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM213	A2RRL7	107 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	XRCC3	O43542	346 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	CEL	P19835	753 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINB10	P48595	397 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF585B	Q52M93	769 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	NRG4	Q8WWG1	115 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM80	Q96HE8	168 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	TM2D1	Q9BX74	207 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511		S4R3C0	116 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		8.02	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	HMX3	A6NHT5	357 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	TRDC	B7Z8K6	153 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	SOCS1	O15524	211 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	DHFR	P00374	187 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	SRM	P19623	302 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	MMD2	Q8IY49	270 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	MARC2	Q969Z3	335 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	MLST8	Q9BVC4	326 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		8.01	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MWP6	167 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	MYL12B	O14950	172 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	FABP7	O15540	132 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	CD3G	P09693	182 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFA4	P12838	97 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	CTRB1	P17538	263 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	PTTG1IP	P53801	180 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	UNC119	Q13432	240 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK10	Q15131	360 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5B3	Q8NH48	314 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	GINS4	Q9BRT9	223 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		8	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0A6YYD4	124 aa		7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLL5	B9A064	214 aa		7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	MYOD1	P15172	320 aa		7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	TCTA	P57738	103 aa		7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	BLOC1S1	P78537	153 aa		7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	IGSF11	Q5DX21	431 aa		7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		7.99	□□□□□ -1.13
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		7.99	□□□□□ -1.13

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