RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 SMIM6P0DI80 62 aa14.41□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 TIMP3P35625 211 aa14.41□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 SPSB4Q96A44 273 aa14.41□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.41□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 DHRS11Q6UWP2 260 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 THSD7BQ9C0I4 1608 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 CACNA1EQ15878 2313 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 C1QL1O75973 258 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 PLAUP00749 431 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 MAS1LP35410 378 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 DDB2Q92466 427 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 CELA3BP08861 270 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 TSPOP30536 169 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 NPIPB3Q92617 1050 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 NABP2Q9BQ15 211 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 SPRR3Q9UBC9 169 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-213ENST00000489895 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 RAX2Q96IS3 184 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 TWIST1Q15672 202 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 BET1LQ9NYM9 111 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 PINLYPA6NC86 204 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 H0YL77 283 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 REG1AP05451 166 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 LCN2P80188 198 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 A0A0G2JLM5 398 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 CXorf65A6NEN9 183 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 CA2P00918 260 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 HLA-DQA1P01909 254 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 RRN3P1Q2M238 152 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 AREGP15514 252 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 J3QRE1 110 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 FAM201AQ5SY85 155 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 YPEL1O60688 119 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 YPEL2Q96QA6 119 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 PET117Q6UWS5 81 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 OR4A47Q6IF82 309 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 TRGV3P03979 118 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 TBR1Q16650 682 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 SCGB1D4Q6XE38 83 aa14.36□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 SIP14410 1827 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 MOSP00540 346 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 IL4P05112 153 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 RLFQ13129 1914 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 GGNQ86UU5 652 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 A1L4Q6 167 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 TMEM250H0YL14 139 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 KLK2P20151 261 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 RELBQ01201 579 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 FBXL15Q9H469 300 aa14.35□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 SIAH2O43255 324 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 IGKV1D-33P01593 117 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 IGKV1-33P01594 117 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 WDR82Q6UXN9 313 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 C17orf98A8MV24 154 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 CA7P43166 264 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 DLX6P56179 175 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 C7orf69Q9H7B7 122 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 ANK1P16157 1881 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 LYZL4Q96KX0 146 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 PRO1933Q9H354 126 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 AUP1Q9Y679 476 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 HAX1O00165 279 aa14.34□□□□□ -0.11
NISCH-213ENST00000489895 CRYGSP22914 178 aa14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms