RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 GGCTO75223 188 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 TPPPO94811 219 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 ATP6V1G2O95670 118 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 IGLV2-14P01704 120 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 FCGR2CP31995 323 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 CD81P60033 236 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 HAGHQ16775 308 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 ZFAND6Q6FIF0 208 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 NPIPB5A8MRT5 1133 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 SSX5O60225 188 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 DEFA4P12838 97 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 CATR1Q13166 79 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 SSX9Q7RTT3 188 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 LAX1Q8IWV1 398 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 OR13F1Q8NGS4 319 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 HRASLSQ9HDD0 168 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 SLC2A9Q9NRM0 540 aa15.3■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 TNCP24821 2201 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 IZUMO1RA6ND01 250 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 PPP5D1E7EU14 171 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 TNFSF12O43508 249 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 GUCA2BQ16661 112 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 ZNF773Q6PK81 442 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB34Q8NCN2 500 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 OR4A5Q8NH83 315 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 NEURL2Q9BR09 285 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 CCL28Q9NRJ3 127 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 A0A0A6YYH2 397 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 A6NJ64 397 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 ARL3P36405 182 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 RPL8P62917 257 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 MSMO1Q15800 293 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 SPAG16Q8N0X2 631 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 SLC5A7Q9GZV3 580 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHA3Q9HB20 300 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 CEPT1Q9Y6K0 416 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 ZNF320A2RRD8 509 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 TEX22C9J3V5 150 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 OR2C1O95371 312 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 ZNF735P0CB33 412 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 FOLR2P14207 255 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 PSMB6P28072 239 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 CBX5P45973 191 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 MECP2P51608 486 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 FXYD4P59646 89 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 FAM106AQ4KMX7 169 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 CLEC19AQ6UXS0 136 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 HOGA1Q86XE5 327 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 GVQW1Q8N7I0 195 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 OR5H6Q8NGV6 325 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 EDA2RQ9HAV5 297 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-212ENST00000484841 C2orf70A6NJV1 201 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 LGALS9O00182 355 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 PPYP01298 95 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3-23P01764 117 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 CLEC2LP0C7M8 214 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 HLA-GP17693 338 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 NEDD8Q15843 81 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 BORCS5Q969J3 196 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 GPHA2Q96T91 129 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 IFT46Q9NQC8 304 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 BET1LQ9NYM9 111 aa15.26■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 CYB5BO43169 146 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 TMEM127O75204 238 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 NDUFB8O95169 186 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 HPRT1P00492 218 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 FCER2P06734 321 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 CRYGCP07315 174 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 PTHLHP12272 177 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 AREGP15514 252 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 HERV-K104P61576 105 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 OR4A47Q6IF82 309 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 GPHB5Q86YW7 130 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 DMBX1Q8NFW5 382 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 SLC25A38Q96DW6 304 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 CXorf58Q96LI9 332 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 COMMD5Q9GZQ3 224 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 RNF167Q9H6Y7 350 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 THYN1Q9P016 225 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 S4R3C0 116 aa15.25■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa15.24■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 E7EUB6 86 aa15.24■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 SULT1C2O00338 296 aa15.24■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.033e-25■■■■■ 34.8
ACTB-212ENST00000484841 BRWD1-AS2P59051 145 aa15.24■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 TAS2R31P59538 309 aa15.24■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa15.24■□□□□ 0.03
ACTB-212ENST00000484841 SLC16A13Q7RTY0 426 aa15.24■□□□□ 0.03
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