RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 OR4A47Q6IF82 309 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 OR4D10Q8NGI6 311 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 OR2A7Q96R45 310 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 MTFP1Q9UDX5 166 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 K7EIL1 84 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.083e-6■□□□□ 10.1
ATG4B-210ENST00000428861 HPRT1P00492 218 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 CD3DP04234 171 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 RPA2P15927 270 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 KIR2DS2P43631 304 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF616Q08AN1 781 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 POU2AF1Q16633 256 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF585BQ52M93 769 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 MMD2Q8IY49 270 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 FCAMRQ8WWV6 532 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 DCUN1D4Q92564 292 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 PHB2Q99623 299 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 SLA2Q9H6Q3 261 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 SCOCQ9UIL1 159 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 LINC01619G3V211 115 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 H3BUA1 57 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 GPR31O00270 319 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TPPPO94811 219 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 BRI3O95415 125 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 HRASP01112 189 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV12-3P01733 135 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TAS2R31P59538 309 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TSPAN5P62079 268 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 CATR1Q13166 79 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 FAAP20Q6NZ36 180 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM68Q96MH6 324 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 SOSTQ9BQB4 213 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM140Q9NV12 185 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 COA4Q9NYJ1 87 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 BET1LQ9NYM9 111 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 GABARAPH6UMI1 98 aa8.26□□□□□ -1.09
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ATG4B-210ENST00000428861 IGKV1D-39P04432 117 aa8.26□□□□□ -1.09
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ATG4B-210ENST00000428861 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 MRAPQ8TCY5 172 aa8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 DPF1Q92782 380 aa8.26□□□□□ -1.09
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ATG4B-210ENST00000428861 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 MPPED1O15442 326 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 ACTL6BO94805 426 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 REG1AP05451 166 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 CD40LGP29965 261 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 TNFSF8P32971 234 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 G6PCP35575 357 aa8.25□□□□□ -1.09
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ATG4B-210ENST00000428861 RHOGP84095 191 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 IL18Q14116 193 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 REC114Q7Z4M0 266 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 OR4A5Q8NH83 315 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-210ENST00000428861 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.25□□□□□ -1.09
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