RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586792.5

ZNF540-204, Transcript of zinc finger protein 540, human

TSL 3 BASIC

Gene ZNF540, Length 564 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF540-204	ENST00000586792	PRRT1	Q99946	306 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	PSMB11	A5LHX3	300 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM74A7	A6NL05	159 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	LINC00587	B1AMM8	73 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792		H3BSH0	61 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792		M0QXV9	152 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC1A7	O00341	560 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ENTPD6	O75354	484 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC22A5	O76082	557 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	BRI3	O95415	125 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TTR	P02766	147 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	IL7	P13232	177 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	MYL12A	P19105	171 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	GABRR1	P24046	479 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	GABRA2	P47869	451 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	CX3CL1	P78423	397 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF45	Q02386	682 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	GRK1	Q15835	563 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TP53I3	Q53FA7	332 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	WDR38	Q5JTN6	314 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	CLLU1	Q5K131	121 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	AHSA2	Q719I0	299 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	STOML3	Q8TAV4	291 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	CYGB	Q8WWM9	190 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	PP6455	Q8WZ26	134 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ISOC1	Q96CN7	298 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	BORCS8	Q96FH0	119 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC6A7	Q99884	636 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	MLX	Q9UH92	298 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	OR2AT4	A6NND4	320 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	LEUTX	A8MZ59	168 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SRRM5	B3KS81	715 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792		G3V4G9	280 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792		J3QLW9	94 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792		J3QT63	122 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	RHOD	O00212	210 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ATP5L	O75964	103 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	CD2	P06729	351 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF19	P17023	458 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ANOS1	P23352	680 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TGFBR2	P37173	567 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	PMEL	P40967	661 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	RBP2	P50120	134 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	FUT6	P51993	359 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	FGF12	P61328	243 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	RAB40B	Q12829	278 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	PSG5	Q15238	335 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	CTF1	Q16619	201 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	GUCA2B	Q16661	112 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	WDR86	Q86TI4	376 aa		3.78	□□□□□ -1.8

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