RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487386.1

LINC00888-204, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

BASIC

Gene LINC00888, Length 421 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-204ENST00000487386 SPANXN2Q5MJ10 180 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 GLYATL3Q5SZD4 288 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 IDNKQ5T6J7 187 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 HES5Q5TA89 166 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 TMEM244Q5VVB8 128 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 FBXW9Q5XUX1 488 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 TRIQKQ629K1 86 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 PLCXD3Q63HM9 321 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 C16orf87Q6PH81 154 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 FAM131AQ6UXB0 335 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 BIVMQ86UB2 503 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 MDP1Q86V88 176 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 C17orf78Q8N4C9 275 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 SLC22A24Q8N4F4 322 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 JAGN1Q8N5M9 183 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 BHLHE23Q8NDY6 225 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 OR56B2PQ8NGI1 322 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 OR51A2Q8NGJ7 313 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 OR5D18Q8NGL1 313 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 OR2G2Q8NGZ5 317 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 OR51E1Q8TCB6 317 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 RNF133Q8WVZ7 376 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 SLC7A6Q92536 515 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 GHSRQ92847 366 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 BORCS5Q969J3 196 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 RMI2Q96E14 147 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 REEP6Q96HR9 211 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 ZFP3Q96NJ6 502 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 GPER1Q99527 375 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 PBOV1Q9GZY1 135 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 AUNIPQ9H7T9 357 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 HMG20AQ9NP66 347 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 ABCB9Q9NP78 766 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 GPR84Q9NQS5 396 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 ASF1BQ9NVP2 202 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 EXTL2Q9UBQ6 330 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 ATPIF1Q9UII2 106 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 HHLA2Q9UM44 414 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 FAM215AQ9Y5M1 114 aa2.06□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 C5orf49A4QMS7 147 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 C5orf63A6NC05 138 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 GGT3PA6NGU5 568 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 A6NIN4 97 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 OR4C45A6NMZ5 311 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 CLDN25C9JDP6 229 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 AIPO00170 330 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 MAGEB3O15480 346 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 SULT1B1O43704 296 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 DHRS3O75911 302 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 PAHP00439 452 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 APOC1P02654 83 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 UCHL1P09936 223 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 CECR9P0C854 216 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 IGHV1-8P0DP01 117 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 CCL2P13500 99 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 ATF1P18846 271 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 RAB3AP20336 220 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 CRYGSP22914 178 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 UGT2B10P36537 528 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 CRYBB2P43320 205 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 UQCRFS1P47985 274 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 RORCP51449 518 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 ZNF83P51522 516 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 CLDN12P56749 244 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 ERVS71-1P61550 626 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 RPS23P62266 143 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 ZNF846Q147U1 533 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 GUSBP1Q15486 140 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 POU2AF1Q16633 256 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 PRSS8Q16651 343 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 HIST3H3Q16695 136 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 LINC00303Q3SY05 128 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 TEX30Q5JUR7 227 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 UBE2NLQ5JXB2 153 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 TMEM69Q5SWH9 247 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 ZNF684Q5T5D7 378 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 PRR9Q5T870 116 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 GLT8D1Q68CQ7 371 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 DRAM2Q6UX65 266 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 Q6ZT83 130 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 NEGR1Q7Z3B1 354 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 DPPA2Q7Z7J5 298 aa2.05□□□□□ -2.08
LINC00888-204ENST00000487386 WDR86Q86TI4 376 aa2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.8 ms