RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486587.1

LRSAM1-208, Transcript of leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1, human

TSL 3

Gene LRSAM1, Length 827 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRSAM1-208	ENST00000486587	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	TGFBR1	P36897	503 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	SYNJ2BP	P57105	145 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	IDNK	Q5T6J7	187 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	TPRA1	Q86W33	373 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	TEX45	Q8NA69	505 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	CENPO	Q9BU64	300 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	SPATA2	Q9UM82	520 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LRSAM1-208	ENST00000486587	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587		A0A0G2JLM5	398 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	HLA-DQB1	P01920	261 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	CD36	P16671	472 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZP3	P21754	424 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	TNFSF12	O43508	249 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	SCGN	O76038	276 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	OR9G9	P0C7N8	305 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	ARPC4	P59998	168 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	RHOG	P84095	191 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF45	Q02386	682 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	CDK10	Q15131	360 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	HMX3	A6NHT5	357 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	IGLV1-51	P01701	117 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	AADAC	P22760	399 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	SSX9	Q7RTT3	188 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	RCHY1	Q96PM5	261 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	ACTL6B	O94805	426 aa		13.67	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	MYOD1	P15172	320 aa		13.67	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	RPEL1	Q2QD12	228 aa		13.67	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		13.67	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	OR4S2	Q8NH73	311 aa		13.67	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.67	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	ETV7	Q9Y603	341 aa		13.67	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	BMPR1B	O00238	502 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	FXYD4	P59646	89 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	MMD2	Q8IY49	270 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587		A0A1B0GW64	132 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	TEX22	C9J3V5	150 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	OR2J3	O76001	311 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	KBTBD11	O94819	623 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	FCGR2C	P31995	323 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	USMG5	Q96IX5	58 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587		S4R3C0	116 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LRSAM1-208	ENST00000486587	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	PPP5D1	E7EU14	171 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587		E7EUB6	86 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	BRI3	O95415	125 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	IGHV3-23	P01764	117 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	TMEM17	Q86X19	198 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587		Q8N1Y9	231 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	MFSD4A	Q8N468	514 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	FAM223B	A6NKX1	122 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	SLC22A5	O76082	557 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	PPY	P01298	95 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	REG1A	P05451	166 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	CSN3	P07498	182 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	AREG	P15514	252 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	EDN2	P20800	178 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LRSAM1-208	ENST00000486587	ATP5G2	Q06055	141 aa		13.63	□□□□□ -0.23

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