RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 SLAIN2Q9P270 581 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF3AQ9Y496 699 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 PLCH1Q4KWH8 1693 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCC12Q96J65 1359 aa10.91□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 TAF5LO75529 589 aa10.91□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 ADCK5Q3MIX3 580 aa10.91□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 USPL1Q5W0Q7 1092 aa10.91□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 USP48Q86UV5 1035 aa10.91□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSCAN30Q86W11 494 aa10.91□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.91□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 RDH13Q8NBN7 331 aa10.91□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 KLHDC4Q8TBB5 520 aa10.91□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 AKAP2Q9Y2D5 859 aa10.91□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 EYA2O00167 538 aa10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 MCM5P33992 734 aa10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT85P78386 507 aa10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXO4P98177 505 aa10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 FUT2Q10981 343 aa10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 UVSSAQ2YD98 709 aa10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 NBPF14Q5TI25 921 aa10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 NBPF15Q8N660 670 aa10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 DBNDD2Q9BQY9 259 aa10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 RBSNQ9H1K0 784 aa10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 PAG1Q9NWQ8 432 aa10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.9□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 ELP1O95163 1332 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 STARD3NLO95772 234 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 ME3Q16798 604 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC57Q2TAC2 916 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 MORN1Q5T089 497 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF697Q5TEC3 545 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 NEK1Q96PY6 1258 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 SPSB2Q99619 263 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 DSCC1Q9BVC3 393 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 MTMR6Q9Y217 621 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 CNPY2Q9Y2B0 182 aa10.89□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 TNFRSF10AO00220 468 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 FIBPO43427 364 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 GDF9O60383 454 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 LARGE1O95461 756 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 CPA1P15085 419 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 FGD1P98174 961 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC158Q5M9N0 1113 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 TTLL7Q6ZT98 887 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 THAP11Q96EK4 314 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 PDLIM2Q96JY6 352 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 NEUROD6Q96NK8 337 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 ISCA1Q9BUE6 129 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 PLA2G12BQ9BX93 195 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 STRN4Q9NRL3 753 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 TPCN1Q9ULQ1 816 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 CDHR2Q9BYE9 1310 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 TCIRG1Q13488 830 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 GORABQ5T7V8 394 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 ATG9AQ7Z3C6 839 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 GTF3C6Q969F1 213 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 CTNNA3Q9UI47 895 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLIM4O00461 696 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 A1BGP04217 495 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC39AQ5SRH9 613 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1B0GUL7 405 aa10.85□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa10.85□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 PTMAP06454 111 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
EFTUD2-222ENST00000592408 HSPA1LP34931 641 aa10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms