RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570112.1

MKRN3-205, Transcript of makorin ring finger protein 3, human

TSL 2

Gene MKRN3, Length 470 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKRN3-205	ENST00000570112	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	AOX1	Q06278	1338 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	SCN4A	P35499	1836 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	IGSF3	O75054	1194 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	LDHC	P07864	332 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	GSTO1	P78417	241 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	MAP3K12	Q12852	859 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	PRDX5	P30044	214 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	SHTN1	A0MZ66	631 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	MYO1B	O43795	1136 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	CRK	P46108	304 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	GRIK5	Q16478	980 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	PCNT	O95613	3336 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	POTEC	B2RU33	542 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	PDE4A	P27815	886 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	MECOM	Q03112	1051 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKRN3-205	ENST00000570112	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	BAG3	O95817	575 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	CYP7A1	P22680	504 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	RGS3	P49796	1198 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	WNT10B	O00744	389 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	HTRA3	P83110	453 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	EGFR	P00533	1210 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	PDE6A	P16499	860 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	BTD	P43251	543 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	TOMM70	O94826	608 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	PLCG2	P16885	1265 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	TNNI2	P48788	182 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MKRN3-205	ENST00000570112	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24

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