RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 ABCF2Q9UG63 623 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 SPDYE6P0CI01 402 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 TEKT1Q969V4 418 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 RAB11FIP3O75154 756 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 PRDX5P30044 214 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 CDCA5Q96FF9 252 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PITX1-204ENST00000504936 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 SPATA5Q8NB90 893 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 GRM1Q13255 1194 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 CST9Q5W186 159 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 PI16Q6UXB8 463 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 KLRG1Q96E93 195 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 SNRKQ9NRH2 765 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 NF2P35240 595 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 MCAMP43121 646 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 AOX1Q06278 1338 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 CNTNAP1P78357 1384 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 TNFAIP1Q13829 316 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 RAI14Q9P0K7 980 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX1-204ENST00000504936 HUNKP57058 714 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 SLF2Q8IX21 1173 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 TNNI2P48788 182 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 CACNB3P54284 484 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 PRKG1Q13976 671 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 DOCK2Q92608 1830 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 ZBTB22O15209 634 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 ZAP70P43403 619 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 MYH7P12883 1935 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 PCNTO95613 3336 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 RASSF10A6NK89 507 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 MRIQ9BWK5 157 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 ECE1P42892 770 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 VEGFBP49765 207 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 GSTO1P78417 241 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 MECOMQ03112 1051 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 RASA3Q14644 834 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 DCTPP1Q9H773 170 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 CAPNS2Q96L46 248 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-204ENST00000504936 LDHCP07864 332 aa23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms