RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GUL7	405 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	TFCP2	Q12800	502 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	TNN	Q9UQP3	1299 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-231	ENST00000496246	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	PANK1	Q8TE04	598 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	TIMM10	P62072	90 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	GSTO1	P78417	241 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE3A	Q14432	1141 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	RLBP1	P12271	317 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	PHKA1	P46020	1223 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKG1	Q13976	671 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	POLA2	Q14181	598 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	RASA3	Q14644	834 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	WBP1L	Q9NX94	342 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB22	O15209	634 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	AOC2	O75106	756 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	LDHC	P07864	332 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC10A3	P09131	477 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	ADORA1	P30542	326 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	SREBF2	Q12772	1141 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP85	Q6P2H3	762 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXN1	O15353	648 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	IGSF3	O75054	1194 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	BAG3	O95817	575 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	PRDX5	P30044	214 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	LBX1	P52954	281 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	INHBE	P58166	350 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms