RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
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RABGGTB-209ENST00000473406 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-209ENST00000473406 GDF9O60383 454 aa8.31□□□□□ -1.08
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RABGGTB-209ENST00000473406 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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RABGGTB-209ENST00000473406 KANK3Q6NY19 840 aa8.31□□□□□ -1.08
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RABGGTB-209ENST00000473406 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-209ENST00000473406 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.3□□□□□ -1.08
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RABGGTB-209ENST00000473406 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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RABGGTB-209ENST00000473406 JDP2Q8WYK2 163 aa8.29□□□□□ -1.08
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RABGGTB-209ENST00000473406 NME2P22392 152 aa8.28□□□□□ -1.08
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RABGGTB-209ENST00000473406 LAMC2Q13753 1193 aa8.28□□□□□ -1.08
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RABGGTB-209ENST00000473406 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
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RABGGTB-209ENST00000473406 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 SULF2Q8IWU5 870 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM178BQ8IXR5 827 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP89Q96ST8 783 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 PBX4Q9BYU1 374 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 MUC3BQ9H195 1237 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 STRN4Q9NRL3 753 aa8.26□□□□□ -1.09
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.25□□□□□ -1.09
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RABGGTB-209ENST00000473406 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PQH9 124 aa8.24□□□□□ -1.09
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RABGGTB-209ENST00000473406 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 CNGA1P29973 690 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 GPLD1P80108 840 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP11AP98196 1134 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 SCARF1Q14162 830 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 IFFO2Q5TF58 517 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
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