RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 WBP1LQ9NX94 342 aa29.63■■■□□ 2.33
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SMKR1-201ENST00000462322 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
SMKR1-201ENST00000462322 ECM29Q5VYK3 1845 aa29.62■■■□□ 2.33
SMKR1-201ENST00000462322 MAP2K2P36507 400 aa29.62■■■□□ 2.33
SMKR1-201ENST00000462322 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
SMKR1-201ENST00000462322 TEKT1Q969V4 418 aa29.62■■■□□ 2.33
SMKR1-201ENST00000462322 COG6Q9Y2V7 657 aa29.62■■■□□ 2.33
SMKR1-201ENST00000462322 MAST3O60307 1309 aa29.62■■■□□ 2.33
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SMKR1-201ENST00000462322 SPDYE2Q495Y8 402 aa29.6■■■□□ 2.33
SMKR1-201ENST00000462322 CEP85Q6P2H3 762 aa29.6■■■□□ 2.33
SMKR1-201ENST00000462322 MOB2Q70IA6 237 aa29.6■■■□□ 2.33
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SMKR1-201ENST00000462322 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa29.6■■■□□ 2.33
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SMKR1-201ENST00000462322 THSD7BQ9C0I4 1608 aa29.59■■■□□ 2.33
SMKR1-201ENST00000462322 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.58■■■□□ 2.33
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SMKR1-201ENST00000462322 NOGQ13253 232 aa29.58■■■□□ 2.33
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SMKR1-201ENST00000462322 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.45■■■□□ 2.31
SMKR1-201ENST00000462322 CA12O43570 354 aa29.44■■■□□ 2.3
SMKR1-201ENST00000462322 MCAMP43121 646 aa29.44■■■□□ 2.3
SMKR1-201ENST00000462322 CDAN1Q8IWY9 1227 aa29.44■■■□□ 2.3
SMKR1-201ENST00000462322 SLF2Q8IX21 1173 aa29.44■■■□□ 2.3
SMKR1-201ENST00000462322 PRDM10Q9NQV6 1147 aa29.44■■■□□ 2.3
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