RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 FAM160A1Q05DH4 1040 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-202ENST00000420808 LINC00301Q8NCQ3 95 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-202ENST00000420808 MYRIPQ8NFW9 859 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-202ENST00000420808 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa18.2■□□□□ 0.5
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NISCH-202ENST00000420808 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
NISCH-202ENST00000420808 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
NISCH-202ENST00000420808 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
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NISCH-202ENST00000420808 FBXL16Q8N461 479 aa18.19■□□□□ 0.5
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NISCH-202ENST00000420808 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa18.17■□□□□ 0.5
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NISCH-202ENST00000420808 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
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NISCH-202ENST00000420808 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
NISCH-202ENST00000420808 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
NISCH-202ENST00000420808 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.57e-7■■■□□ 17.6
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NISCH-202ENST00000420808 COL4A1P02462 1669 aa18.17■□□□□ 0.5
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NISCH-202ENST00000420808 ADALQ6DHV7 355 aa18.16■□□□□ 0.5
NISCH-202ENST00000420808 ZNF34Q8IZ26 560 aa18.16■□□□□ 0.5
NISCH-202ENST00000420808 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
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NISCH-202ENST00000420808 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
NISCH-202ENST00000420808 AIDAQ96BJ3 306 aa18.14■□□□□ 0.49
NISCH-202ENST00000420808 ALG1Q9BT22 464 aa18.14■□□□□ 0.49
NISCH-202ENST00000420808 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
NISCH-202ENST00000420808 TRDNQ13061 729 aa18.14■□□□□ 0.49
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NISCH-202ENST00000420808 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
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NISCH-202ENST00000420808 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa18.14■□□□□ 0.49
NISCH-202ENST00000420808 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa18.13■□□□□ 0.49
NISCH-202ENST00000420808 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NISCH-202ENST00000420808 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NISCH-202ENST00000420808 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa18.13■□□□□ 0.49
NISCH-202ENST00000420808 ABCC12Q96J65 1359 aa18.13■□□□□ 0.49
NISCH-202ENST00000420808 ZMYM6O95789 1325 aa18.13■□□□□ 0.49
NISCH-202ENST00000420808 BECN2A8MW95 431 aa18.13■□□□□ 0.49
NISCH-202ENST00000420808 ANO1Q5XXA6 986 aa18.13■□□□□ 0.49
NISCH-202ENST00000420808 KRT40Q6A162 431 aa18.13■□□□□ 0.49
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