RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC14Q49A88 953 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 LMBR1LQ6UX01 489 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D5Q92609 795 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC114Q96M63 670 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 SPAG5Q96R06 1193 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 SELENOOQ9BVL4 669 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 VAT1LQ9HCJ6 419 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 SLC5A1P13866 664 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-202ENST00000400053 KIF5AQ12840 1032 aa10.03□□□□□ -0.8
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PTPRM-202ENST00000400053 CREB3L3Q68CJ9 461 aa10.03□□□□□ -0.8
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PTPRM-202ENST00000400053 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
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PTPRM-202ENST00000400053 ADCY10Q96PN6 1610 aa10.03□□□□□ -0.8
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PTPRM-202ENST00000400053 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa10.02□□□□□ -0.81
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PTPRM-202ENST00000400053 UGGT1Q9NYU2 1555 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GUL7 405 aa10.01□□□□□ -0.81
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PTPRM-202ENST00000400053 EXOC1Q9NV70 894 aa10.01□□□□□ -0.81
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PTPRM-202ENST00000400053 STAT6P42226 847 aa10□□□□□ -0.81
PTPRM-202ENST00000400053 KRT83P78385 493 aa10□□□□□ -0.81
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PTPRM-202ENST00000400053 B4DLN1 442 aa10□□□□□ -0.81
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PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB16Q05516 673 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRM-202ENST00000400053 CFAP58Q5T655 872 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRM-202ENST00000400053 DCAF5Q96JK2 942 aa9.99□□□□□ -0.81
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