RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 DPY19L2Q6NUT2 758 aa35.79■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 C8orf34Q49A92 452 aa35.79■■■■□ 3.32
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ECHS1-201ENST00000368547 RPS12P25398 132 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 MECOMQ03112 1051 aa35.77■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP35.77■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa35.75■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF384Q8TF68 577 aa35.75■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 MYH2Q9UKX2 1941 aa35.75■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 GLTPD2A6NH11 291 aa35.75■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEB6Q8N7X4 407 aa35.75■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 SCNN1DP51172 638 aa35.74■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 DPF2Q92785 391 aa35.74■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 MAST3O60307 1309 aa35.73■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 CHGBP05060 677 aa35.73■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L8P0C7I0 530 aa35.73■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa35.73■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 IGSF3O75054 1194 aa35.72■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 PDE6AP16499 860 aa35.72■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 DIXDC1Q155Q3 683 aa35.72■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa35.72■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 OGFOD1Q8N543 542 aa35.72■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 SHTN1A0MZ66 631 aa35.71■■■■□ 3.31
ECHS1-201ENST00000368547 ADD2P35612 726 aa35.71■■■■□ 3.31
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF532Q9HCE3 1301 aa35.7■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 RFX7Q2KHR2 1363 aa35.69■■■■□ 3.3
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ECHS1-201ENST00000368547 CYP7A1P22680 504 aa35.69■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 GSTO1P78417 241 aa35.69■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 MICALL2Q8IY33 904 aa35.69■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 GPRC5DQ9NZD1 345 aa35.69■■■■□ 3.3
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ECHS1-201ENST00000368547 ADGRA1Q86SQ6 560 aa35.68■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 SLF2Q8IX21 1173 aa35.68■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 TEKT1Q969V4 418 aa35.68■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 SERPINA10Q9UK55 444 aa35.68■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 CRKP46108 304 aa35.67■■■■□ 3.3
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ECHS1-201ENST00000368547 UBE3CQ15386 1083 aa35.67■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 TICAM2Q86XR7 235 aa35.67■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
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ECHS1-201ENST00000368547 MRIQ9BWK5 157 aa35.66■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 LDHCP07864 332 aa35.65■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 HHIPL2Q6UWX4 724 aa35.65■■■■□ 3.3
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ECHS1-201ENST00000368547 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa35.65■■■■□ 3.3
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ECHS1-201ENST00000368547 MMP14P50281 582 aa35.65■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP35.65■■■■□ 3.3
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ECHS1-201ENST00000368547 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa35.65■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 WDR90Q96KV7 1748 aa35.64■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 H7C1D1 291 aa35.64■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 EPS15P42566 896 aa35.64■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa35.64■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 GAKO14976 1311 aa35.64■■■■□ 3.3
ECHS1-201ENST00000368547 HIP1O00291 1037 aa35.63■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 CFAP100Q494V2 611 aa35.63■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 MYOZ2Q9NPC6 264 aa35.63■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 CHMLP26374 656 aa35.62■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 APPBP2Q92624 585 aa35.62■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 FAM227BQ96M60 508 aa35.62■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 ZDHHC15Q96MV8 337 aa35.62■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 SCN4AP35499 1836 aa35.62■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa35.61■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 SAMD7Q7Z3H4 446 aa35.61■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 MIGA1Q8NAN2 632 aa35.61■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 OSBP2Q969R2 916 aa35.61■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 CDC45O75419 566 aa35.6■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 EGFRP00533 1210 aa35.6■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 DLGAP5Q15398 846 aa35.6■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
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ECHS1-201ENST00000368547 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0D9SFI3 127 aa35.59■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP35.59■■■■□ 3.29
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ECHS1-201ENST00000368547 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa35.58■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 BTDP43251 543 aa35.58■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 MTMR14Q8NCE2 650 aa35.58■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.29
ECHS1-201ENST00000368547 SPDYE2BA6NHP3 402 aa35.57■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 POTECB2RU33 542 aa35.57■■■■□ 3.28
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