RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363574.1

RNU6-1339P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1339, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1339P, Length 91 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SEPT6Q14141 434 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MPP2Q14168 576 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PERM1Q5SV97 790 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FAM35AQ86V20 835 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TNFRSF25Q93038 417 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PLD4Q96BZ4 506 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ADAM19Q9H013 955 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NAGPAQ9UK23 515 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CDC14CA4D256 554 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PPFIA3O75145 1194 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CILPO75339 1184 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 BMP4P12644 408 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TCEAL1Q15170 157 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SULF2Q8IWU5 870 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PTPRAP18433 802 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ARNTP27540 789 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GIPRP48546 466 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RASA3Q14644 834 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KANK3Q6NY19 840 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SNTG2Q9NY99 539 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KLF15Q9UIH9 416 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MCM4P33991 863 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ADH7P40394 386 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF165P49910 485 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LAPTM4AQ15012 233 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LRRC14Q15048 493 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TNNI3KQ59H18 835 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 REC114Q7Z4M0 266 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MDFIQ99750 246 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CLCQ05315 142 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SV2AQ7L0J3 742 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PDZD3Q86UT5 571 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CBX8Q9HC52 389 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ARAFP10398 606 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EPHA1P21709 976 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HSD3B2P26439 372 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GK5Q6ZS86 529 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ENPP3O14638 875 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1339P-201ENST00000363574 BPNT1O95861 308 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MX2P20592 715 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ADH6P28332 368 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CDC27P30260 824 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IKBKEQ14164 716 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TTC9Q92623 222 aa6.71□□□□□ -1.34
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