RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 DBNDD2Q9BQY9 259 aa18.41■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CYP4F22Q6NT55 531 aa18.4■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 VEZTQ9HBM0 779 aa18.4■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa18.4■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SALL1Q9NSC2 1324 aa18.4■□□□□ 0.54
CSAG1-201ENST00000361211 MYO1BO43795 1136 aa18.39■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.39■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 GORABQ5T7V8 394 aa18.39■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 TEKT1Q969V4 418 aa18.39■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.39■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 MCAMP43121 646 aa18.38■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 HUNKP57058 714 aa18.38■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.38■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 MOB2Q70IA6 237 aa18.38■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 MAST3O60307 1309 aa18.38■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 PCNTO95613 3336 aa18.38■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa18.37■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 HMMRO75330 724 aa18.37■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 LDHBP07195 334 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 GRM1Q13255 1194 aa18.37■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 C2orf69Q8N8R5 385 aa18.37■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 RHPN1Q8TCX5 695 aa18.37■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 CAPNS2Q96L46 248 aa18.37■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 ZDHHC15Q96MV8 337 aa18.37■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB129Q9H1M3 183 aa18.37■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 SSC5DA1L4H1 1573 aa18.37■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 THSD7BQ9C0I4 1608 aa18.37■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 APBB1O00213 710 aa18.36■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 CACNB3P54284 484 aa18.36■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 HHIPL2Q6UWX4 724 aa18.36■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 ERC1Q8IUD2 1116 aa18.36■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA5Q8NB90 893 aa18.36■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 HHIPL1Q96JK4 782 aa18.36■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 MRIQ9BWK5 157 aa18.36■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa18.36■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 ABCF2Q9UG63 623 aa18.36■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa18.36■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 TCP10L2B9ZVM9 353 aa18.35■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa18.35■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 TTC39AQ5SRH9 613 aa18.35■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 CRBNQ96SW2 442 aa18.35■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 FZD1Q9UP38 647 aa18.35■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.34■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 AOC2O75106 756 aa18.34■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa18.34■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 RASA3Q14644 834 aa18.34■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC158Q5M9N0 1113 aa18.34■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.34■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 AACSQ86V21 672 aa18.34■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 CDAN1Q8IWY9 1227 aa18.34■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 SNRKQ9NRH2 765 aa18.34■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.34■□□□□ 0.53
CSAG1-201ENST00000361211 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ECE1P42892 770 aa18.33■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 FKBP1BP68106 108 aa18.33■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 PRKG1Q13976 671 aa18.33■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF384Q8TF68 577 aa18.33■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.33■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.32■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 NF2P35240 595 aa18.32■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 TNFAIP1Q13829 316 aa18.32■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 RGMBQ6NW40 437 aa18.32■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ZIC5Q96T25 663 aa18.32■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM39BQ9GZU3 492 aa18.32■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18.32■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 MYH2Q9UKX2 1941 aa18.31■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 GAKO14976 1311 aa18.31■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 RAB11FIP3O75154 756 aa18.31■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ZAP70P43403 619 aa18.31■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 MECOMQ03112 1051 aa18.31■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.31■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 TEPSINQ96N21 525 aa18.31■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 BCL11AQ9H165 835 aa18.31■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa18.3■□□□□ 0.52
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms