RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 MECOMQ03112 1051 aa23.43■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 MAP4K1Q92918 833 aa23.43■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 FBXW7Q969H0 707 aa23.43■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 AIDAQ96BJ3 306 aa23.43■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 CHD4Q14839 1912 aa23.43■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 PRDX5P30044 214 aa23.43■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 PTH1RQ03431 593 aa23.43■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 GPAA1O43292 621 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 LDHCP07864 332 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 SLF2Q8IX21 1173 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.42■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L3A6NCW0 530 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L4A6NCW7 530 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.41■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 HSPA4P34932 840 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.4■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.39■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 GNAT2P19087 354 aa23.39■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 ANAPC15P60006 121 aa23.39■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 NIM1KQ8IY84 436 aa23.39■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
VSTM2B-201ENST00000335523 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 MBD4O95243 580 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 RNF20Q5VTR2 975 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 NFKBIEO00221 500 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF384Q8TF68 577 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 JDP2Q8WYK2 163 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 NECTIN1Q15223 517 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 DOCK2Q92608 1830 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 BAG3O95817 575 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 GRIK5Q16478 980 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 DACT2Q5SW24 774 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 VPS53Q5VIR6 699 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 CERS3Q8IU89 383 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 ARMT1Q9H993 441 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 APPP05067 770 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 CERS5Q8N5B7 392 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 YDJCA8MPS7 323 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 KCNB2Q92953 911 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 MYH7P12883 1935 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 YY1P25490 414 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 LCORLQ8N3X6 602 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 MRIQ9BWK5 157 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM2B-201ENST00000335523 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 PPP4CP60510 307 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 RABEP1Q15276 862 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 ALX1Q15699 326 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 IL17RAQ96F46 866 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF2CQ99661 725 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 MXD3Q9BW11 206 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC27A2O14975 620 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 FGAP02671 866 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 IL27Q8NEV9 243 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 PALD1Q9ULE6 856 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 F8W031 263 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 RAD17O75943 681 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 PLCG2P16885 1265 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 RASSF7Q02833 373 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 KRT32Q14532 448 aa23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms