RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308271.13

USP48-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP48, Length 4,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48-201ENST00000308271 CAPZA3Q96KX2 299 aa21.91■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 USP28Q96RU2 1077 aa21.91■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.9■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.9■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa21.9■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.9■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 IQUBQ8NA54 791 aa21.9■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 VAV2P52735 878 aa21.9■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.9■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 KIF2CQ99661 725 aa21.9■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 ATP2B2Q01814 1243 aa21.89■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.89■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 PPM1EQ8WY54 764 aa21.89■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 DRC1Q96MC2 740 aa21.89■■□□□ 1.1
USP48-201ENST00000308271 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa21.89■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 NF2P35240 595 aa21.89■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.89■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 ARHGEF10O15013 1369 aa21.89■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 GOPCQ9HD26 462 aa21.89■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.89■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 ATP8B1O43520 1251 aa21.88■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 TMTC1Q8IUR5 882 aa21.88■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.88■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 TNRQ92752 1358 aa21.88■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 A6NNZ2 444 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 MTX1Q13505 466 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 TUBB8Q3ZCM7 444 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 MAP4K1Q92918 833 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 ATP5JP18859 108 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 USP5P45974 858 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 SUCLG2Q96I99 432 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 PFKFB2O60825 505 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 GPTP24298 496 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 TMEM87BQ96K49 555 aa21.87■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.86■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 A0A0D9SFI3 127 aa21.86■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 CCDC91Q7Z6B0 441 aa21.86■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 ZBTB9Q96C00 473 aa21.86■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.86■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.86■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 RXRAP19793 462 aa21.85■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.85■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 KRT2P35908 639 aa21.85■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa21.85■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.85■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 PDE4BQ07343 736 aa21.85■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 CCDC121Q6ZUS5 278 aa21.85■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 TSPY2A6NKD2 308 aa21.84■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 ZEB2O60315 1214 aa21.84■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 BICDL2A1A5D9 508 aa21.84■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 KAT14Q9H8E8 782 aa21.84■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 TIMM10P62072 90 aa21.84■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 CFAP58Q5T655 872 aa21.84■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.84■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 IP6K1Q92551 441 aa21.84■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa21.84■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 RTL9Q8NET4 1388 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 A0A1W2PQ27 194 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 A0A1W2PQ64 194 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 A0A1W2PQD8 194 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 CALM1P0DP23 149 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 CALM2P0DP24 149 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 CALM3P0DP25 149 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 PFKFB1P16118 471 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 GNAT2P19087 354 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 PLCD3Q8N3E9 789 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 NEK11Q8NG66 645 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
USP48-201ENST00000308271 EZRP15311 586 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
USP48-201ENST00000308271 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
USP48-201ENST00000308271 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
USP48-201ENST00000308271 VGLL3A8MV65 326 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms