RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266254.11

TTLL1-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL1, Length 1,645 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-201ENST00000266254 USP26Q9BXU7 913 aa27.34■■□□□ 1.97
TTLL1-201ENST00000266254 CLEC11AQ9Y240 323 aa27.34■■□□□ 1.97
TTLL1-201ENST00000266254 PSMD14O00487 310 aa27.34■■□□□ 1.97
TTLL1-201ENST00000266254 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
TTLL1-201ENST00000266254 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
TTLL1-201ENST00000266254 FAM227BQ96M60 508 aa27.34■■□□□ 1.97
TTLL1-201ENST00000266254 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.97
TTLL1-201ENST00000266254 GPRC5DQ9NZD1 345 aa27.34■■□□□ 1.97
TTLL1-201ENST00000266254 DENND2AQ9ULE3 1009 aa27.34■■□□□ 1.97
TTLL1-201ENST00000266254 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
TTLL1-201ENST00000266254 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF804AQ7Z570 1209 aa27.33■■□□□ 1.97
TTLL1-201ENST00000266254 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.33■■□□□ 1.97
TTLL1-201ENST00000266254 A0A0D9SFI3 127 aa27.32■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.32■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa27.32■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 TXNRD3Q86VQ6 643 aa27.32■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 IL25Q9H293 177 aa27.32■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 KCNQ5Q9NR82 932 aa27.32■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 APLP1P51693 650 aa27.3■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 HELLSQ9NRZ9 838 aa27.3■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa27.29■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 PODNQ7Z5L7 613 aa27.29■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa27.28■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 CEP350Q5VT06 3117 aa27.28■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 IDH1O75874 414 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 MAP3K12Q12852 859 aa27.27■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 MICALL2Q8IY33 904 aa27.27■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 COA1Q9GZY4 146 aa27.27■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
TTLL1-201ENST00000266254 H7C1D1 291 aa27.26■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 MCCP23508 829 aa27.26■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 RPS12P25398 132 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 DPF2Q92785 391 aa27.26■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 CHGBP05060 677 aa27.25■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 VIL1P09327 827 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 ADD2P35612 726 aa27.25■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa27.25■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 UBE3CQ15386 1083 aa27.24■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 APPBP2Q92624 585 aa27.24■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 FBXW7Q969H0 707 aa27.24■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 LRP2BPQ9P2M1 347 aa27.24■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 CCDC171Q6TFL3 1326 aa27.24■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 SCN9AQ15858 1988 aa27.24■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 SHTN1A0MZ66 631 aa27.23■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 USP17L3A6NCW0 530 aa27.23■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 USP17L4A6NCW7 530 aa27.23■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 USP17L1Q7RTZ2 530 aa27.23■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 CD209Q9NNX6 404 aa27.23■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 MAST2Q6P0Q8 1798 aa27.23■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 IL1R1P14778 569 aa27.23■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 PDE6AP16499 860 aa27.23■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa27.22■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 ABCF2Q9UG63 623 aa27.22■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 MAST3O60307 1309 aa27.22■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 HTRA3P83110 453 aa27.21■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 SLFNL1Q499Z3 407 aa27.21■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 WDR66Q8TBY9 1149 aa27.21■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF532Q9HCE3 1301 aa27.2■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 PTH1RQ03431 593 aa27.2■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 AGBL3Q8NEM8 1001 aa27.2■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 TRPM4Q8TD43 1214 aa27.2■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 OSBP2Q969R2 916 aa27.2■■□□□ 1.95
TTLL1-201ENST00000266254 SALL1Q9NSC2 1324 aa27.2■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa27.19■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 MAGEB6Q8N7X4 407 aa27.19■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.19■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa27.19■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 M0R2C6 588 aa27.19■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 IGSF3O75054 1194 aa27.19■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 HSPA4P34932 840 aa27.19■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 SAMD7Q7Z3H4 446 aa27.19■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 MAP4K1Q92918 833 aa27.19■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 RAI14Q9P0K7 980 aa27.19■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 STRIP1Q5VSL9 837 aa27.18■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.18■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 ANAPC15P60006 121 aa27.17■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TTLL1-201ENST00000266254 PASKQ96RG2 1323 aa27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms