RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254616.10

TIMM10B-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 10B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM10B, Length 2,840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM10B-201ENST00000254616 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 SLC39A14Q15043 492 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 HPSEQ9Y251 543 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 NRDCO43847 1150 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ANO1Q5XXA6 986 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 TTLL7Q6ZT98 887 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 SDF4Q9BRK5 362 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 WDR17Q8IZU2 1322 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 DOCK2Q92608 1830 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 RIC1Q4ADV7 1423 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 MYH3P11055 1940 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 FGAP02671 866 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 TCIRG1Q13488 830 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 NCAPHQ15003 741 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 TTC39AQ5SRH9 613 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 FCHSD1Q86WN1 690 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CREBRFQ8IUR6 639 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ABCA3Q99758 1704 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ANTXR2P58335 489 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 JMYQ8N9B5 988 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 XAGE2Q96GT9 111 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.313e-6■□□□□ 9
TIMM10B-201ENST00000254616 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CLIC4Q9Y696 253 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 STK36Q9NRP7 1315 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ZNF202O95125 648 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ATF3P18847 181 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CBX1P83916 185 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CCDC57Q2TAC2 916 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 TOM1O60784 492 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 A0A0G2JLW4 131 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 A0A1B0GVL5 298 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 USP27XA6NNY8 438 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 GOLGA8BA8MQT2 603 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ZNF213O14771 459 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CBFA2T2O43439 604 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 SLU7O95391 586 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 UBE3CQ15386 1083 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ALX1Q15699 326 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 DPCR1Q3MIW9 517 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CCDC93Q567U6 631 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 TMEM87BQ96K49 555 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 FAM177BA6PVY3 158 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 TTLL5Q6EMB2 1281 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 MTA3Q9BTC8 594 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 PFKFB1P16118 471 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 SGMS1Q86VZ5 419 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 TMX1Q9H3N1 280 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ARID5BQ14865 1188 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CADPS2Q86UW7 1296 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CPLX1O14810 134 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ADD2P35612 726 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 PTPAQ15257 358 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 RESP18Q5W5W9 173 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ARMCX5Q6P1M9 558 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CHD4Q14839 1912 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 GPAA1O43292 621 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 RCAN1P53805 252 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 MAP3K14Q99558 947 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 KIF28PB7ZC32 967 aa13.08□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 CUTAO60888 179 aa13.08□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 GUCY1B3Q02153 619 aa13.08□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 HSD3B7Q9H2F3 369 aa13.08□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
TIMM10B-201ENST00000254616 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms