RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000014640.8

Ankrd28-201, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd28, Length 6,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 PpardP35396 440 aa26.42■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gbp1Q01514 589 aa26.42■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa26.42■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fsip1Q9D3V5 435 aa26.42■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mroh7A2AVR2 1279 aa26.42■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Lrrc36Q3V0M2 755 aa26.41■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Kank4Q6P9J5 1016 aa26.41■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ublcp1Q8BGR9 318 aa26.41■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ankrd50F7BE84 1390 aa26.41■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 PtprgQ05909 1442 aa26.41■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Samd15F6XZJ7 620 aa26.41■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 TsksO54887 585 aa26.41■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Kiaa1328Q6NZK5 612 aa26.41■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ubxn1Q922Y1 297 aa26.41■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ubash3aQ3V3E1 624 aa26.41■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ddx27Q921N6 760 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccdc94Q9D6J3 314 aa26.41■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Lin9Q8C735 542 aa26.41■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Top1Q04750 767 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Sept14Q9DA97 430 aa26.4■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gdpd2Q9ESM6 539 aa26.4■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tdo2P48776 406 aa26.4■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tom1l2Q5SRX1 507 aa26.4■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pla2r1Q62028 1487 aa26.4■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Catsper2A2ARP9 588 aa26.4■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Stmn4P63042 189 aa26.4■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Nsd3Q6P2L6 1439 aa26.4■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm1993A6X8I0 212 aa26.39■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 SlxD3Z347 212 aa26.39■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Acot11Q8VHQ9 594 aa26.39■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gse1Q3U3C9 1213 aa26.39■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccpg1Q640L3 753 aa26.39■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tnnc1P19123 161 aa26.39■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccdc148Q6P5U8 527 aa26.39■■□□□ 1.82
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mmp8O70138 465 aa26.39■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 GabpaQ00422 454 aa26.39■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 TrdnE9Q9K5 693 aa26.39■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ppfibp2O35711 882 aa26.39■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 AU022751B1B0V2 589 aa26.38■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 GancQ8BVW0 898 aa26.38■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Calml3Q9D6P8 149 aa26.38■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa26.38■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Eif3j1Q3UGC7 261 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Eif3j2Q66JS6 263 aa26.38■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm29094F6Q785 221 aa26.38■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 RbsnQ80Y56 783 aa26.38■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccnt1Q9QWV9 724 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Abcc4E9Q236 1325 aa26.38■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 SdsQ8VBT2 327 aa26.38■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa26.38■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Traf1P39428 409 aa26.38■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cfap100Q80VN0 613 aa26.38■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Bloc1s4Q8VED2 215 aa26.37■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Aox4Q3TYQ9 1336 aa26.37■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tex35Q14BK3 207 aa26.37■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Myl10Q62082 202 aa26.37■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mettl5Q8K1A0 209 aa26.37■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mug2P28666 1451 aa26.37■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tsr2Q8C8T8 191 aa26.36■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Taok3Q8BYC6 898 aa26.36■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa26.36■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 NpatQ8BMA5 1420 aa26.36■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Stk36Q69ZM6 1316 aa26.36■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm5934D3Z4U6 212 aa26.36■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gsta4P24472 222 aa26.36■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Aifm3Q3TY86 605 aa26.36■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pdzd9Q9D9M4 266 aa26.36■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Prdm11A2AGX3 565 aa26.35■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Zkscan16A2ALW2 728 aa26.35■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ehbp1Q69ZW3 1231 aa26.35■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 HelbQ6NVF4 1074 aa26.35■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tab2Q99K90 693 aa26.35■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cfap65Q3V0B4 1847 aa26.35■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fez2Q6TYB5 348 aa26.35■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pm20d1Q8C165 503 aa26.35■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Plcd1Q8R3B1 756 aa26.35■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Nlgn1Q99K10 843 aa26.35■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Atp6v0a2P15920 856 aa26.34■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Kifap3P70188 793 aa26.34■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 VrtnQ3SYK4 740 aa26.34■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Clul1Q3ZRW6 464 aa26.34■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tmtc2Q56A06 836 aa26.34■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Psrc1Q9D0P7 329 aa26.34■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cbfa2t2O70374 594 aa26.34■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Zkscan4Q5SZT6 480 aa26.34■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Appbp2Q9DAX9 585 aa26.34■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Vat1lQ80TB8 417 aa26.33■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tacc3Q9JJ11 631 aa26.33■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mast1Q9R1L5 1570 aa26.33■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pdrg1P59048 133 aa26.33■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa26.33■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rexo1Q7TT28 1213 aa26.33■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fam135bQ9DAI6 1403 aa26.33■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Serpinb6bO08804 377 aa26.33■■□□□ 1.81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 PaoxQ8C0L6 504 aa26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 147.2 ms