RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574997.1

TRIM25-209, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 3

Gene TRIM25, Length 440 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-209	ENST00000574997	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	PHB2	Q99623	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	VCX	Q9H320	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	SCN3B	Q9NY72	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	AK3	Q9UIJ7	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	LGALS9	O00182	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	MPPED1	O15442	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	SOCS1	O15524	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	DHFR	P00374	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	CD3G	P09693	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	CTXN2	P0C2S0	81 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	GADD45A	P24522	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	TMEM50B	P56557	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	RCN1	Q15293	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	RAB11B	Q15907	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	PRSS8	Q16651	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997		Q6ZS49	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	UFD1	Q92890	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	PDCD5	O14737	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	FABP7	O15540	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	MAS1L	P35410	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	CD81	P60033	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	MED22	Q15528	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	PECR	Q9BY49	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997		V9GY05	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRIM25-209	ENST00000574997		A0A0A6YYD4	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIM25-209	ENST00000574997	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIM25-209	ENST00000574997	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIM25-209	ENST00000574997	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRIM25-209	ENST00000574997	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIM25-209	ENST00000574997	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIM25-209	ENST00000574997	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIM25-209	ENST00000574997	BET1	O15155	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIM25-209	ENST00000574997	NDUFB8	O95169	186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRIM25-209	ENST00000574997	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms