RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TUSC2	O75896	110 aa		8.13	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1-16	P04430	117 aa		8.13	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	APELA	P0DMC3	54 aa		8.13	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGN3	Q15651	99 aa		8.13	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC58	Q4VC31	144 aa		8.13	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		8.13	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		8.13	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	8.13	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		8.13	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	8.13	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF221	Q9UK13	617 aa		8.13	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		8.13	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPK0	400 aa		8.12	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5G2	Q06055	141 aa		8.12	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CBX3	Q13185	183 aa		8.12	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	8.12	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		8.12	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	XAF1	Q6GPH4	301 aa		8.12	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	PDPN	Q86YL7	162 aa		8.12	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		8.12	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		8.12	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		8.12	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CYYR1	Q96J86	154 aa		8.12	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		8.12	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	8.12	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	FOLR2	P14207	255 aa		8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPG	P40121	348 aa		8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CEACAM6	P40199	344 aa		8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511		Q499Y3	187 aa		8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	LYG2	Q86SG7	212 aa		8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM19	Q96E16	107 aa		8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		8.11	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	KMT2A	Q03164	3969 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	MSGN1	A6NI15	193 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf70	A6NJV1	201 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM223B	A6NKX1	122 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R1X1	148 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	BMPR1B	O00238	502 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	EI24	O14681	340 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP8B1	O43520	1251 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	OR9G9	P0C7N8	305 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB25	P24278	435 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	BMI1	P35226	326 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DS2	P43631	304 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOG	P84095	191 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	NHLH2	Q02577	135 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF383	Q8NA42	475 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	HARBI1	Q96MB7	349 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM140	Q9NV12	185 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		8.1	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGB1BP1	O14713	200 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRY2	O43597	315 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTL6B	O94805	426 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	PRH1	P02810	166 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ALPL	P05186	524 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	LIMS3	P0CW19	117 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	LIMS4	P0CW20	117 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP2K4	P45985	399 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	APOC4	P55056	127 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00205	P59089	165 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF9	Q07011	255 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TNXA	Q16473	311 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB135	Q30KP9	77 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	GHRL	Q9UBU3	117 aa		8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	8.09	□□□□□ -1.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		8.08	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF320	A2RRD8	509 aa		8.08	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP5D1	E7EU14	171 aa		8.08	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	DYNC1I1	O14576	645 aa		8.08	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	8.08	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	8.08	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	MYL12A	P19105	171 aa		8.08	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	EDN2	P20800	178 aa		8.08	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	ETV1	P50549	477 aa		8.08	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	8.08	□□□□□ -1.12
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH26	Q8IXH8	852 aa		8.08	□□□□□ -1.12

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