RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	ARPC1A	Q92747	370 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	SNAPC3	Q92966	411 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	DIABLO	Q9NR28	239 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	SHOX	O15266	292 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	TUSC2	O75896	110 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	CRYZL1	O95825	349 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	CTXN2	P0C2S0	81 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	RAB9A	P51151	201 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	ARPC4	P59998	168 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	GNB1	P62873	340 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	FXYD3	Q14802	87 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM177	Q53S58	311 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM65	Q6PI78	240 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	HOGA1	Q86XE5	327 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	LFNG	Q8NES3	379 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	GPHA2	Q96T91	129 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876	COL7A1	Q02388	2944 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPSA-208	ENST00000487876		I3L521	148 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	XRCC3	O43542	346 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM127	O75204	238 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	AADAC	P22760	399 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	CBX3	Q13185	183 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	FHL3	Q13643	280 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	ACTBL2	Q562R1	376 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	KCTD9	Q7L273	389 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	OR11H1	Q8NG94	326 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	VSIG4	Q9Y279	399 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	FCGR3B	O75015	233 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	RRAS	P10301	218 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	FCGR2C	P31995	323 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	LGALS7	P47929	136 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	TAS2R20	P59543	309 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	REC114	Q7Z4M0	266 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	MRAP	Q8TCY5	172 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	MS4A10	Q96PG2	267 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	TNFSF12	O43508	249 aa		10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	GABARAP	O95166	117 aa		10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	CNIH1	O95406	144 aa		10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	IGHV3-11	P01762	117 aa		10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	APELA	P0DMC3	54 aa		10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	UBE2K	P61086	200 aa		10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	RUNX1	Q01196	453 aa		10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	DEFA5	Q01523	94 aa		10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	CTF1	Q16619	201 aa		10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	IFT46	Q9NQC8	304 aa		10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		10	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876		K7EIL1	84 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	HPGDS	O60760	199 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	PPY	P01298	95 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	CBX5	P45973	191 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	TPPP2	P59282	170 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	FXYD4	P59646	89 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	PRSS8	Q16651	343 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	GPR107	Q5VW38	600 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	TEX45	Q8NA69	505 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	OR5T1	Q8NG75	326 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPSA-208	ENST00000487876	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81

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