RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478061.5

RBM28-204, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 3

Gene RBM28, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-204	ENST00000478061	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM28-204	ENST00000478061	GPR31	O00270	319 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	RRH	O14718	337 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	FCGR3B	O75015	233 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	PEX14	O75381	377 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	CRYZL1	O95825	349 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	IGLV2-23	P01705	113 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	ZNF45	Q02386	682 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	CBX3	Q13185	183 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	PSG5	Q15238	335 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	TERB2	Q8NHR7	220 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	BORCS5	Q969J3	196 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	DISC1	C4P0D8	188 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	HAX1	O00165	279 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	SPDEF	O95238	335 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	IGHG2	P01859	326 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	PGAM2	P15259	253 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	KIR2DS2	P43631	304 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	LGALS7	P47929	136 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	BAK1	Q16611	211 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	C3orf56	Q8N813	242 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	OR51H1	Q8NH63	302 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	HARBI1	Q96MB7	349 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	ZNF747	Q9BV97	191 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	FBXL15	Q9H469	300 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	KIAA1456	Q9P272	454 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	LINC01548	A6NM66	108 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	SHOX	O15266	292 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	SLC25A17	O43808	307 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	HLA-DRB1	P01911	266 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	PPP5C	P53041	499 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	AP3S2	P59780	193 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	KRTAP10-3	P60369	221 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	CATR1	Q13166	79 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	LIN54	Q6MZP7	749 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	OR4S2	Q8NH73	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	PRRT1	Q99946	306 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	FCN1	O00602	326 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79	3e-11	■□□□□ 9.1
RBM28-204	ENST00000478061	RAMP3	O60896	148 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	RLN1	P04808	185 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	CRYGB	P07316	175 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	PI3	P19957	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	PLGLA	Q15195	96 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	MCUB	Q9NWR8	336 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	KCNAB3	O43448	404 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	S100G	P29377	79 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	UBE2K	P61086	200 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	RND3	P61587	244 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	TRIQK	Q629K1	86 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	POC5	Q8NA72	575 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	S100Z	Q8WXG8	99 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM28-204	ENST00000478061	CLCC1	Q96S66	551 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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