RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 TNFSF8P32971 234 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 CX3CL1P78423 397 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM16LQ309B1 348 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 YIF1BQ5BJH7 314 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 RAB12Q6IQ22 244 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 LIN54Q6MZP7 749 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 LYPD6Q86Y78 171 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF251Q9BRH9 671 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC32Q9BV29 185 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 FBXL15Q9H469 300 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 BANF2Q9H503 90 aa5.01□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 OR2S2Q9NQN1 319 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA1456Q9P272 454 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa5□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 FABP12A6NFH5 140 aa5□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 A8MZ25 164 aa5□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 MCRIP1C9JLW8 97 aa5□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 IGLV1-51P01701 117 aa5□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 TALDO1P37837 337 aa5□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 PSMD7P51665 324 aa5□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 C6orf183Q5T699 404 aa5□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 IDNKQ5T6J7 187 aa5□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 STEAP3Q658P3 488 aa5□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 FAM131AQ6UXB0 335 aa5□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 TMEM91Q6ZNR0 172 aa5□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 MS4A10Q96PG2 267 aa5□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 IFI27L2Q9H2X8 130 aa5□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 COMMD3Q9UBI1 195 aa5□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 DAPK2Q9UIK4 370 aa5□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.99□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 CT45A6P0DMU7 189 aa4.99□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 CT45A5P0DMU8 189 aa4.99□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 CT45A7P0DMV0 189 aa4.99□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 SRMP19623 302 aa4.99□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 HAGHQ16775 308 aa4.99□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 TMEM30BQ3MIR4 351 aa4.99□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 IL34Q6ZMJ4 242 aa4.99□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF554Q86TJ5 538 aa4.99□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.99□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 YPEL2Q96QA6 119 aa4.99□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 S100A13Q99584 98 aa4.99□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 RETNQ9HD89 108 aa4.99□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 JPT1Q9UK76 154 aa4.99□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 H0YJW9 148 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 HSPA12AO43301 675 aa4.98□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 MGMTP16455 207 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 FUT3P21217 361 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 RANBP1P43487 201 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 INPP1P49441 399 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00205P59089 165 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 HTD2P86397 168 aa4.98□□□□□ -1.61
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