RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598256.1

LTBP4-222, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-222	ENST00000598256	THBS3	P49746	956 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	SCGB2A2	Q13296	93 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	RGS21	Q2M5E4	152 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	OR51H1	Q8NH63	302 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	AJUBA	Q96IF1	538 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	GPHA2	Q96T91	129 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	NABP2	Q9BQ15	211 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	OCEL1	Q9H607	264 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	APOA2	P02652	100 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	SRD5A1	P18405	259 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	BRS3	P32247	399 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	RND3	P61587	244 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	PLET1	Q6UQ28	207 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LTBP4-222	ENST00000598256	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	LINC00473	A8K010	186 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	TIMM23	O14925	209 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	CT45A6	P0DMU7	189 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	CT45A5	P0DMU8	189 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	CT45A7	P0DMV0	189 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	AKR1C4	P17516	323 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	TAS2R31	P59538	309 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF383	Q8NA42	475 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256		H7C2Y5	167 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	RAB13	P51153	203 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	LINC00205	P59089	165 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	CBX3	Q13185	183 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	RTL8B	Q17RB0	113 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	C11orf88	Q6PI97	169 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM230	Q96A57	120 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	HIVEP2	P31629	2446 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256		H0YJW9	148 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	MPPED1	O15442	326 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	F2R	P25116	425 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	MC5R	P33032	325 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	KIR2DS2	P43631	304 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	HES1	Q14469	280 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	TRIM16L	Q309B1	348 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	DDB2	Q92466	427 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	CFHR4	Q92496	578 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	SSX3	Q99909	188 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	NAA60	Q9H7X0	242 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	BTBD17	A6NE02	478 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	FCGR3B	O75015	233 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	VENTX	O95231	258 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	IGKV1D-33	P01593	117 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	IGKV1-33	P01594	117 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	RRAS	P10301	218 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	SPN	P16150	400 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	VAMP1	P23763	118 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	CD1B	P29016	333 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	RAB25	P57735	213 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	PDPN	Q86YL7	162 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	OR4S2	Q8NH73	311 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	BEX1	Q9HBH7	125 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256	VGLL3	A8MV65	326 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LTBP4-222	ENST00000598256		H0Y980	276 aa		12.79	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms