RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586792.5

ZNF540-204, Transcript of zinc finger protein 540, human

TSL 3 BASIC

Gene ZNF540, Length 564 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF540-204	ENST00000586792	TEAD3	Q99594	435 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	NICN1	Q9BSH3	213 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792		V9GYY9	64 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	HIVEP1	P15822	2718 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792		A0A1B0GVI7	797 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792		A0A1B0GVY2	172 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	C15orf62	A8K5M9	175 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792		M0R129	80 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	HSPB6	O14558	160 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	WNT9B	O14905	357 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	MPZL2	O60487	215 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ALOX5AP	P20292	161 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC2A5	P22732	501 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ID1	P41134	155 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	KRTAP10-3	P60369	221 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	LMO4	P61968	165 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM3A	P98173	230 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	PRDX4	Q13162	271 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ASAH1	Q13510	395 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	MEF2D	Q14814	521 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SPRN	Q5BIV9	151 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	UTF1	Q5T230	341 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	IDNK	Q5T6J7	187 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	C12orf73	Q69YU5	71 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	CBR4	Q8N4T8	237 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	POC1A	Q8NBT0	407 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	OR2T27	Q8NH04	317 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	OR52E5	Q8NH55	327 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	AP3S1	Q92572	193 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	MARC2	Q969Z3	335 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	CNBD2	Q96M20	576 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	OR5M11	Q96RB7	305 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	OR8B4	Q96RC9	309 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	AMELY	Q99218	206 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TBX5	Q99593	518 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	CLN6	Q9NWW5	311 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	COA4	Q9NYJ1	87 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	GHRL	Q9UBU3	117 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ROS1	P08922	2347 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	PLCE1	Q9P212	2302 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792		A0A0G2JK05	382 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	DAPL1	A0PJW8	107 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	OR5B21	A6NL26	309 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	MPTX1	A8MV57	137 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792		A8MXK9	166 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792		E9PQ18	207 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	CLDN34	H7C241	214 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	CCS	O14618	274 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SH2D1B	O14796	132 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	CHST1	O43916	411 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	ADAP1	O75689	374 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	SC5D	O75845	299 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	DHRS3	O75911	302 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	FSTL3	O95633	263 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	IFNA5	P01569	189 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ZNF540-204	ENST00000586792	GLRA1	P23415	457 aa		3.81	□□□□□ -1.8

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