RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 CCL13Q99616 98 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 CLN8Q9UBY8 286 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 SCO1O75880 301 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 CST7O76096 145 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 CLDN14O95500 239 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 KRASP01116 189 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 G6PCP35575 357 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 SULT1A1P50225 295 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 RAB5CP51148 216 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF134P52741 427 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 TAS2R30P59541 319 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 MIDNQ504T8 468 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 STX12Q86Y82 276 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 HRH4Q9H3N8 390 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 GAB2Q9UQC2 676 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 RAB29O14966 203 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 ZG16O60844 167 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 CD3EP07766 207 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 RAB7AP51149 207 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 TNFRSF9Q07011 255 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 PTPN13Q12923 2485 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 H3BP45 60 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM178BH3BS89 294 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 DFFBO76075 338 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 M6PRP20645 277 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 ATP6V0CP27449 155 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00205P59089 165 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2KP61086 200 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 EFNB3Q15768 340 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 NEUROG1Q92886 237 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 ATP5SQ99766 215 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 PSENENQ9NZ42 101 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM218A2RU14 115 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 PPIAL4DF5H284 164 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 TMPRSS2O15393 492 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.339e-9■■■■■ 33
PDE4D-208ENST00000502484 HPRT1P00492 218 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 APOC3P02656 99 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 IAPPP10997 89 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 AKR1C1Q04828 323 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 MARCH11A6NNE9 402 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 B9A039 149 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM77I1YAP6 450 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 SLC31A2O15432 143 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 CAMLGP49069 296 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 LINC01560Q8TB33 94 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-208ENST00000502484 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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