RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 ZNF695Q8IW36 515 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 FOXRED2Q8IWF2 684 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 OR4K15Q8NH41 348 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 DPF1Q92782 380 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 SNAPC3Q92966 411 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 Q9N2K0 584 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 IFT46Q9NQC8 304 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 ZFP57Q9NU63 452 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 TENM3Q9P273 2699 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 C12orf77C9JDV5 145 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 CCL24O00175 119 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 LUMP51884 338 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 ZNF134P52741 427 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 F2RL1P55085 397 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 ACTBP60709 375 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 STEAP3Q658P3 488 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 LYSMD2Q8IV50 215 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 PRR18Q8N4B5 295 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 LINC00311Q8N616 119 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 BEST4Q8NFU0 473 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 OR52M1Q8NGK5 317 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 OR1L1Q8NH94 360 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 SETD6Q8TBK2 473 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 B9D2Q9BPU9 175 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 AP4M1O00189 453 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 HLA-DMAP28067 261 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 CT45A1Q5HYN5 189 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 TEX38Q6PEX7 206 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZS49 121 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 COMMD1Q8N668 190 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 TMEM229BQ8NBD8 167 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 ZNF439Q8NDP4 499 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 CT45A3Q8NHU0 189 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 S1PR3Q99500 378 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 TRDCB7Z8K6 153 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 PLA2G10O15496 165 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 MOSP00540 346 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 HBZP02008 142 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 CD74P04233 296 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 CD3DP04234 171 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 GSTT2BP0CG30 244 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 CD1BP29016 333 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 HLA-DRB3P79483 266 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 GNMTQ14749 295 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 HMGN3Q15651 99 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 TOMM5Q8N4H5 51 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 PRR25Q96S07 402 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 PALMDQ9NP74 551 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R8Q9NYW2 309 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 M0QYG6 137 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 FABP7O15540 132 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 SCTP09683 121 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 GSTT2P0CG29 244 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 TBPP20226 339 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 SLC6A1P30531 599 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 HRH1P35367 487 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 INPP1P49441 399 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R19P59542 299 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 AP3S2P59780 193 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 CFHR3Q02985 330 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 ASAH1Q13510 395 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 DYRK1AQ13627 763 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 KIR2DS1Q14954 304 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 C6orf183Q5T699 404 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 C8orf31Q8N9H6 132 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 OR4D10Q8NGI6 311 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 OR4C16Q8NGL9 310 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 RITA1Q96K30 269 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 TAF9BQ9HBM6 251 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 GNG12Q9UBI6 72 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 MGAT4AQ9UM21 535 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-212ENST00000485532 SPINT2O43291 252 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms