RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A087WW49	117 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464		M0R1X1	148 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	GSTT2	P0CG29	244 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	GSTT2B	P0CG30	244 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	GNB3	P16520	340 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	RAB6A	P20340	208 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	GAL	P22466	123 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	ECI1	P42126	302 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	INSL3	P51460	131 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	PSMD7	P51665	324 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	SLURP1	P55000	103 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	PLGLA	Q15195	96 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464		Q6ZS49	121 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	RHOV	Q96L33	236 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	CLCC1	Q96S66	551 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF221	Q9UK13	617 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	RAB26	Q9ULW5	256 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC01619	G3V211	115 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	PDCD5	O14737	125 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	OVOL1	O14753	267 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	BET1	O15155	118 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC25A17	O43808	307 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	OR8U9	P0C7N5	309 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	RAB3B	P20337	219 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	SERPINB10	P48595	397 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	GABARAPL2	P60520	117 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	ACTBL2	Q562R1	376 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	C22orf42	Q6IC83	251 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	LFNG	Q8NES3	379 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	DDB2	Q92466	427 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	ARPC1A	Q92747	370 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2D2	Q9H210	308 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PTPRF-211	ENST00000467464	SMIM30	A4D0T7	59 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3-11	P01762	117 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	APOA2	P02652	100 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	MYL9	P24844	172 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	RANBP1	P43487	201 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM177	Q53S58	311 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ACSM6	Q6P461	480 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF429	Q86V71	674 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	SPART	Q8N0X7	666 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	9.21	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	9.2	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	GADD45A	P24522	165 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	9.2	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	FXYD3	Q14802	87 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	9.2	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	POC5	Q8NA72	575 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	MS4A10	Q96PG2	267 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A075B6Q4	140 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ERICH4	A6NGS2	130 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC00473	A8K010	186 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	NOTO	A8MTQ0	251 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464		H3BUA1	57 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	BRI3	O95415	125 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ATP6V1G2	O95670	118 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	SPN	P16150	400 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	DTYMK	P23919	212 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	LGALS7	P47929	136 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TPPP2	P59282	170 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	BVES	Q8NE79	360 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	HARBI1	Q96MB7	349 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TENM3	Q9P273	2699 aa		9.19	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	SSX5	O60225	188 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	SAP30	O75446	220 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	IGLV2-14	P01704	120 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TRGV3	P03979	118 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	CDNF	Q49AH0	187 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ASCL2	Q99929	193 aa		9.18	□□□□□ -0.94

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