RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC38A6Q8IZM9 456 aa12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF383Q8NA42 475 aa12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR1L6Q8NGR2 347 aa12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBLIM1Q8WUP2 373 aa12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BANF2Q9H503 90 aa12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXL17Q9UF56 701 aa12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRSS29PA6NIE9 313 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPPED1O15442 326 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XRCC3O43542 346 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLV2-23P01705 113 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRYGBP07316 175 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APELAP0DMC3 54 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP6AP1Q15904 470 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NECAP1Q8NC96 275 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CACNG8Q8WXS5 425 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MUL1Q969V5 352 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM46BQ96A09 425 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LGALS12Q96DT0 336 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q96M66 194 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MED4Q9NPJ6 270 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CKLFQ9UBR5 152 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MLXQ9UH92 298 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF221Q9UK13 617 aa12.25□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP5D1E7EU14 171 aa12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2C1O95371 312 aa12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM106AQ4KMX7 169 aa12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC58Q4VC31 144 aa12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AWAT2Q6E213 333 aa12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR4A47Q6IF82 309 aa12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JAGN1Q8N5M9 183 aa12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2C3Q8N628 320 aa12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UXS1Q8NBZ7 420 aa12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC35D1Q9NTN3 355 aa12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERVK13-1Q9NX77 482 aa12.24□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A8MWP6 167 aa12.23□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PROP1O75360 226 aa12.23□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTRB1P17538 263 aa12.23□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBTB25P24278 435 aa12.23□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CBX3Q13185 183 aa12.23□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTRB2Q6GPI1 263 aa12.23□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HARBI1Q96MB7 349 aa12.23□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEDD4LQ96PU5 975 aa12.23□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APLNQ9ULZ1 77 aa12.23□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DMRT1Q9Y5R6 373 aa12.23□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SELENOKQ9Y6D0 94 aa12.23□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF320A2RRD8 509 aa12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM213A2RRL7 107 aa12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRH1P02810 166 aa12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEACAM6P40199 344 aa12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MED22Q15528 200 aa12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C15orf32Q32M92 178 aa12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BTNL8Q6UX41 500 aa12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MOB1BQ7L9L4 216 aa12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDH26Q8IXH8 852 aa12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SVOPQ8N4V2 548 aa12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MARC2Q969Z3 335 aa12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTX4Q96A99 478 aa12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNAH6Q9C0G6 4158 aa12.22□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLL5B9A064 214 aa12.21□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00205P59089 165 aa12.21□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNXAQ16473 311 aa12.21□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ORAI1Q96D31 301 aa12.21□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYYR1Q96J86 154 aa12.21□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POMPQ9Y244 141 aa12.21□□□□□ -0.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAT2Q9NYQ8 4349 aa12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C11orf94C9JXX5 98 aa12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 M0R1X1 148 aa12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SHOXO15266 292 aa12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARL3P36405 182 aa12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF880Q6PDB4 577 aa12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A42Q86VD7 318 aa12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SETD6Q8TBK2 473 aa12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GALNT14Q96FL9 552 aa12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPIN2AQ99865 258 aa12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RARRES2Q99969 163 aa12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP6D1Q9H9H5 199 aa12.2□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2J3O76001 311 aa12.19□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAPSAO96009 420 aa12.19□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRSS8Q16651 343 aa12.19□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VMA21Q3ZAQ7 101 aa12.19□□□□□ -0.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM177Q53S58 311 aa12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms