RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 HAND1O96004 215 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 HRASP01112 189 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 CRYAAP02489 173 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TDGF1P13385 188 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 PMS2P11Q13670 270 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF146Q15072 292 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 Q6ZR03 302 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF664Q8N3J9 261 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 NCOR1O75376 2440 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 SH2D1BO14796 132 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 SMPD2O60906 423 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 NDUFB7P17568 137 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 CHRNA7P36544 502 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 NUBP1P53384 320 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 RNF212BA8MTL3 300 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 DVL1O14640 695 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 PPP1CBP62140 327 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 OR10P1Q8NGE3 313 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 DERL1Q9BUN8 251 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 HBZP02008 142 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 UBE2G2P60604 165 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 MRGPRDQ8TDS7 321 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 GALMQ96C23 342 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 DEFB108AA8MXU0 73 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 PAX1P15863 534 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 HOXA6P31267 233 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 SSTR5P35346 364 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 MEOX1P50221 254 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 MSMO1Q15800 293 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 SLC25A40Q8TBP6 338 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 LINC00473A8K010 186 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 RAC2P15153 192 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 COX5AP20674 150 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 MPLP40238 635 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TBC1D28Q2M2D7 210 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 Q8IYB0 196 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 RFESDQ8TAC1 157 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 MISP3Q96FF7 219 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 PRO3102Q9H379 93 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 A0A1B0GUS0 222 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 C11orf94C9JXX5 98 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 ATP5G3P48201 142 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 ACTL10Q5JWF8 245 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 DCAF10Q5QP82 559 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 MANBALQ9NQG1 85 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 A8MWP6 167 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 IFNA10P01566 189 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 COL8A2P25067 703 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 MPV17P39210 176 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 GABRA2P47869 451 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 PSG7Q13046 419 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF766Q5HY98 468 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 Q8N7P7 452 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 COQ2Q96H96 371 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 METRNQ9UJH8 293 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 SPRY4Q9C004 299 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 WASF3Q9UPY6 502 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 SSX2Q16385 188 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 FAM78BQ5VT40 261 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF709Q8N972 641 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF114Q8NC26 417 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 ST8SIA5O15466 376 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 LYZL6O75951 148 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 MBP02144 154 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 ATP6V1FQ16864 119 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 LTC4SQ16873 150 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 Q3ZCU0 254 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms