RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568631.5

RNPS1-223, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-223	ENST00000568631	PNKD	Q8N490	385 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM186	Q96B77	213 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	TP53RK	Q96S44	253 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	PROP1	O75360	226 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	IGLV1-47	P01700	117 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	SRPX	P78539	464 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM187	Q14656	261 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	GATA3	P23771	443 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF137P	P52743	207 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	FCN2	Q15485	313 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	LGI3	Q8N145	548 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	PFDN1	O60925	122 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	UCP1	P25874	307 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	HCP5	Q6MZN7	132 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	LIN54	Q6MZP7	749 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	TBX15	Q96SF7	602 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	PRR13	Q9NZ81	148 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	DBX1	A6NMT0	343 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	ARG1	P05089	322 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	SERPINE2	P07093	398 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	THBS3	P49746	956 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	LRTM2	Q8N967	370 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	POLQ	O75417	2590 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	LINC00473	A8K010	186 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	KLRD1	Q13241	179 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	AKAP14	Q86UN6	197 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM56	Q96MV1	263 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	TACC2	O95359	2948 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-223	ENST00000568631	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.15	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.15	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	GOSR2	O14653	212 aa		13.15	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	CDS2	O95674	445 aa		13.15	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	KIR2DS2	P43631	304 aa		13.15	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	GZMK	P49863	264 aa		13.15	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.15	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		13.15	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	IL22RA2	Q969J5	263 aa		13.15	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.15	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.15	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	APC	P25054	2843 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	CCNK	O75909	580 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	CT45A6	P0DMU7	189 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	CT45A5	P0DMU8	189 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	CT45A7	P0DMV0	189 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	RPA2	P15927	270 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	HLA-G	P17693	338 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	CXCL3	P19876	107 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	HTR1D	P28221	377 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	CEACAM3	P40198	252 aa		13.14	□□□□□ -0.31

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