RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.7□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.7□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.7□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 OR2D2Q9H210 308 aa14.7□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 MMP27Q9H306 513 aa14.7□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.7□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 DIABLOQ9NR28 239 aa14.7□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.69□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A0A6YYH2 397 aa14.69□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 A6NJ64 397 aa14.69□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa14.69□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 H0YJW9 148 aa14.69□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 TFAP2AP05549 437 aa14.69□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 ALDH3B2P48448 385 aa14.69□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 CD83Q01151 205 aa14.69□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.69□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A1W2PRX2 142 aa14.68□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 PSMB11A5LHX3 300 aa14.68□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 OR5H14A6NHG9 310 aa14.68□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 M0R1X1 148 aa14.68□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 GABARAPO95166 117 aa14.68□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 NDUFA11Q86Y39 141 aa14.68□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.68□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF383Q8NA42 475 aa14.68□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.68□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 C5orf30Q96GV9 206 aa14.68□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.68□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 H7C2Y5 167 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 J3QRK9 145 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 NBR2O15453 112 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 XRCC3O43542 346 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 FCER2P06734 321 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 MC5RP33032 325 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 SOX6P35712 828 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 GPR141Q7Z602 305 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 STPG2Q8N412 459 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 NPBQ8NG41 125 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 CNIH2Q6PI25 160 aa14.66□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.66□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 GAB2Q9UQC2 676 aa14.66□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.66□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.65□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 AP4M1O00189 453 aa14.65□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNAB3O43448 404 aa14.65□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 NDUFA3O95167 84 aa14.65□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 IGKV1-16P04430 117 aa14.65□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 CTXN2P0C2S0 81 aa14.65□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 RORCP51449 518 aa14.65□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 TAS2R20P59543 309 aa14.65□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.65□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM69Q5SWH9 247 aa14.65□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 HOGA1Q86XE5 327 aa14.65□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 BEST4Q8NFU0 473 aa14.65□□□□□ -0.06
GCSHP2-201ENST00000560971 OPN1MWP04001 364 aa14.64□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.64□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.64□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.64□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 LIN54Q6MZP7 749 aa14.64□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 R3HDM4Q96D70 268 aa14.64□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 FBXL15Q9H469 300 aa14.64□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 KIAA1456Q9P272 454 aa14.64□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.64□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.63□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 RRHO14718 337 aa14.63□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 RBBP9O75884 186 aa14.63□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 HLA-DRB1P01911 266 aa14.63□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 APOA2P02652 100 aa14.63□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.63□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 ARPC4P59998 168 aa14.63□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 SNAPC3Q92966 411 aa14.63□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.62□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 FCN1O00602 326 aa14.62□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 HPGDSO60760 199 aa14.62□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 HLA-DQB1P01920 261 aa14.62□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC35B1P78383 322 aa14.62□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 PSG5Q15238 335 aa14.62□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 PDPNQ86YL7 162 aa14.62□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.62□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 RNF5Q99942 180 aa14.62□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 OR51J1Q9H342 316 aa14.62□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.62□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 TUSC2O75896 110 aa14.61□□□□□ -0.07
GCSHP2-201ENST00000560971 APOA1P02647 267 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90 ms