RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 LHFPL6Q9Y693 200 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-204ENST00000400183 IFITM10A6NMD0 228 aa15.96■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 A0A1W2PS18 150 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 ODAMA1E959 279 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 TMEM189A5PLL7 270 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 SLC35B1P78383 322 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 DLL1O00548 723 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 STARD6P59095 220 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 OR11H4Q8NGC9 324 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 M0R3E3 92 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 CD99P14209 185 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 CD81P60033 236 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 ZNF841Q6ZN19 808 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 STPG3Q8N7X2 389 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 PILRBQ9UKJ0 227 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 PF4V1P10720 104 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 DLL3Q9NYJ7 618 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 DSPPQ9NZW4 1301 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 MT-ND6P03923 174 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 HCP5Q6MZN7 132 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 OR10J6PQ8NGY7 276 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 AUP1Q9Y679 476 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 P2RY4P51582 365 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 TMPRSS3P57727 454 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 PRSS53Q2L4Q9 553 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 PQLC2Q6ZP29 291 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 METTL26Q96S19 204 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 CALYQ9NYX4 217 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 NDUFB4O95168 129 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 MAS1LP35410 378 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 ELOVL1Q9BW60 279 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 COX5BP10606 129 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 FGFRL1Q8N441 504 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 VN1R17PQ8TDU5 208 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 C16orf92Q96LL3 132 aa15.94■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 DNASE2BQ8WZ79 361 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 RBKSQ9H477 322 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 COX6B1P14854 86 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 UNC119Q13432 240 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 TWIST1Q15672 202 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 AQP3Q92482 292 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 FAM206AQ9NX38 181 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 ZFP30Q9Y2G7 519 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 PAM16Q9Y3D7 125 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 FAM90A26D6RGX4 464 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 SMIM10L1P0DMW3 83 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 SLC25A38Q96DW6 304 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 SMIM10Q96HG1 83 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 KCNE5Q9UJ90 142 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 SNAI3Q3KNW1 292 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 SAXO1Q8IYX7 474 aa15.93■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 RELBQ01201 579 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 MARVELD3Q96A59 401 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 ATG101Q9BSB4 218 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 PRDM14Q9GZV8 571 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 IL36RNQ9UBH0 155 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 DIRC3C9JPN6 131 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 ZNHIT1O43257 154 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 FCARP24071 287 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 TM4SF20Q53R12 229 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 SLC25A53Q5H9E4 307 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 TBX15Q96SF7 602 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 WFDC6Q9BQY6 131 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 LMX1BO60663 402 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 COX6A1P12074 109 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 COMPP49747 757 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 LAIR2Q6ISS4 152 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 TEX29Q8N6K0 151 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 TFPI2P48307 235 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 CTHRC1Q96CG8 243 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 OR4C12Q96R67 309 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 HSPB7Q9UBY9 170 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 RND2P52198 227 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 GPR146Q96CH1 333 aa15.92■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 TGIF1Q15583 401 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 OR1N2Q8NGR9 330 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 CDCP2Q5VXM1 449 aa15.91■□□□□ 0.14
USP25-204ENST00000400183 MIEN1Q9BRT3 115 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms