RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 CD177Q8N6Q3 437 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 WFDC1Q9HC57 220 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 ZNF835Q9Y2P0 537 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 IGSF23A1L1A6 192 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 SMCO3A2RU48 225 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 NKX6-3A6NJ46 265 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 M0R1X1 148 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 RAMP3O60896 148 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 FCGR3BO75015 233 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 CATR1Q13166 79 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 FAM209AQ5JX71 171 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 C1orf87Q8N0U7 546 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 BOD1Q96IK1 185 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 MS4A5Q9H3V2 200 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 PSENENQ9NZ42 101 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 ITPR1Q14643 2758 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 PPIHO43447 177 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 FGF2P09038 288 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 ADORA2A-AS1P86434 159 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 TESK1Q15569 626 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 C11orf53Q8IXP5 236 aa11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa11.15□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 CFAP46Q8IYW2 2715 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 H0Y980 276 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 ELLP55199 621 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 ZNF146Q15072 292 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 LDLRAD3Q86YD5 345 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 FAM90A1Q86YD7 464 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 SFT2D1Q8WV19 159 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 OR13C7P0DN81 318 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 GUCA2BQ16661 112 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 Q8NFD4 153 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 COQ2Q96H96 371 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 ODAMA1E959 279 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 CLDN14O95500 239 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 UCP1P25874 307 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 P2RY1P47900 373 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 AKR1E2Q96JD6 320 aa11.14□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 TOR1AO14656 332 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 TUBG1P23258 451 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 OR2B8PP59922 312 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 ZNF266Q14584 549 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 HAGHQ16775 308 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 GPR157Q5UAW9 335 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 Q6ZRM9 215 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 PPIAL4EA0A075B759 164 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 RNF212BA8MTL3 300 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 PPIAL4DF5H284 164 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 PPIAL4FP0DN26 164 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 CDKN1AP38936 164 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 ERVK11-1P61568 191 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 PJVKQ0ZLH3 352 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 IL19Q9UHD0 177 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 PPIAL4AQ9Y536 164 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 A0A1W2PRD5 423 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 A0A1W2PRF3 423 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 A0A1W2PRM7 423 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 CLEC18AA5D8T8 446 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 SRRM5B3KS81 715 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 OPN1MWP04001 364 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 OPN1MW2P0DN77 364 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 OPN1MW3P0DN78 364 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 IL15RAQ13261 267 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 C1orf174Q8IYL3 243 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 LYG1Q8N1E2 194 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 CLEC18CQ8NCF0 446 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 CLN8Q9UBY8 286 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 TNCP24821 2201 aa11.13□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 A8MXK9 166 aa11.12□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 SHOXO15266 292 aa11.12□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 SYNGR2O43760 224 aa11.12□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 ATP6V0CP27449 155 aa11.12□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 OR5D13Q8NGL4 314 aa11.12□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 TMEM218A2RU14 115 aa11.12□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 C17orf98A8MV24 154 aa11.12□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa11.12□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 S1PR2O95136 353 aa11.12□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 LCN15Q6UWW0 184 aa11.12□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.12□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 RPL31P62899 125 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HCN3-201ENST00000368358 TMEM56Q96MV1 263 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms